Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GNPTABQ3T906 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GNPTABQ3T906 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GNPTABQ3T906 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
GNPTABQ3T906 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GNPTABQ3T906 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GNPTABQ3T906 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
GNPTABQ3T906 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GNPTABQ3T906 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GNPTABQ3T906 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GNPTABQ3T906 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GNPTABQ3T906 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GNPTABQ3T906 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GNPTABQ3T906 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GNPTABQ3T906 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GNPTABQ3T906 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GNPTABQ3T906 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GNPTABQ3T906 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GNPTABQ3T906 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GNPTABQ3T906 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
GNPTABQ3T906 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GNPTABQ3T906 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GNPTABQ3T906 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GNPTABQ3T906 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GNPTABQ3T906 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GNPTABQ3T906 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GNPTABQ3T906 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GNPTABQ3T906 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GNPTABQ3T906 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GNPTABQ3T906 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GNPTABQ3T906 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
GNPTABQ3T906 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GNPTABQ3T906 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
GNPTABQ3T906 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GNPTABQ3T906 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GNPTABQ3T906 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GNPTABQ3T906 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GNPTABQ3T906 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
GNPTABQ3T906 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GNPTABQ3T906 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GNPTABQ3T906 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GNPTABQ3T906 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GNPTABQ3T906 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GNPTABQ3T906 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GNPTABQ3T906 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GNPTABQ3T906 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GNPTABQ3T906 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GNPTABQ3T906 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GNPTABQ3T906 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GNPTABQ3T906 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GNPTABQ3T906 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GNPTABQ3T906 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GNPTABQ3T906 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GNPTABQ3T906 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GNPTABQ3T906 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GNPTABQ3T906 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GNPTABQ3T906 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GNPTABQ3T906 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GNPTABQ3T906 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPTABQ3T906 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPTABQ3T906 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GNPTABQ3T906 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GNPTABQ3T906 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPTABQ3T906 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GNPTABQ3T906 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GNPTABQ3T906 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GNPTABQ3T906 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GNPTABQ3T906 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GNPTABQ3T906 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GNPTABQ3T906 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GNPTABQ3T906 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GNPTABQ3T906 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GNPTABQ3T906 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GNPTABQ3T906 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GNPTABQ3T906 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GNPTABQ3T906 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GNPTABQ3T906 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GNPTABQ3T906 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GNPTABQ3T906 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GNPTABQ3T906 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GNPTABQ3T906 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GNPTABQ3T906 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GNPTABQ3T906 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GNPTABQ3T906 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GNPTABQ3T906 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GNPTABQ3T906 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GNPTABQ3T906 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
GNPTABQ3T906 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GNPTABQ3T906 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms