Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KLHL38Q2WGJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KLHL38Q2WGJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KLHL38Q2WGJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KLHL38Q2WGJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KLHL38Q2WGJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KLHL38Q2WGJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KLHL38Q2WGJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KLHL38Q2WGJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KLHL38Q2WGJ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KLHL38Q2WGJ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KLHL38Q2WGJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KLHL38Q2WGJ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KLHL38Q2WGJ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
KLHL38Q2WGJ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KLHL38Q2WGJ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KLHL38Q2WGJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KLHL38Q2WGJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KLHL38Q2WGJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KLHL38Q2WGJ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHL38Q2WGJ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KLHL38Q2WGJ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KLHL38Q2WGJ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KLHL38Q2WGJ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KLHL38Q2WGJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KLHL38Q2WGJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL38Q2WGJ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KLHL38Q2WGJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHL38Q2WGJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL38Q2WGJ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHL38Q2WGJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHL38Q2WGJ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KLHL38Q2WGJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHL38Q2WGJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KLHL38Q2WGJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KLHL38Q2WGJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHL38Q2WGJ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KLHL38Q2WGJ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KLHL38Q2WGJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KLHL38Q2WGJ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHL38Q2WGJ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL38Q2WGJ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL38Q2WGJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KLHL38Q2WGJ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHL38Q2WGJ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHL38Q2WGJ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHL38Q2WGJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHL38Q2WGJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL38Q2WGJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL38Q2WGJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHL38Q2WGJ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHL38Q2WGJ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHL38Q2WGJ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL38Q2WGJ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHL38Q2WGJ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHL38Q2WGJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHL38Q2WGJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHL38Q2WGJ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHL38Q2WGJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHL38Q2WGJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL38Q2WGJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL38Q2WGJ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL38Q2WGJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL38Q2WGJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL38Q2WGJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL38Q2WGJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL38Q2WGJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL38Q2WGJ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHL38Q2WGJ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KLHL38Q2WGJ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL38Q2WGJ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHL38Q2WGJ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHL38Q2WGJ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL38Q2WGJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL38Q2WGJ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL38Q2WGJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms