Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.23■■■■■ 4.67
PROSER3Q2NL68 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PROSER3Q2NL68 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
PROSER3Q2NL68 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PROSER3Q2NL68 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PROSER3Q2NL68 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PROSER3Q2NL68 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
PROSER3Q2NL68 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PROSER3Q2NL68 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PROSER3Q2NL68 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PROSER3Q2NL68 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PROSER3Q2NL68 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PROSER3Q2NL68 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PROSER3Q2NL68 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PROSER3Q2NL68 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PROSER3Q2NL68 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
PROSER3Q2NL68 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PROSER3Q2NL68 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
PROSER3Q2NL68 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PROSER3Q2NL68 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PROSER3Q2NL68 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PROSER3Q2NL68 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PROSER3Q2NL68 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PROSER3Q2NL68 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PROSER3Q2NL68 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PROSER3Q2NL68 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PROSER3Q2NL68 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PROSER3Q2NL68 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PROSER3Q2NL68 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PROSER3Q2NL68 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PROSER3Q2NL68 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PROSER3Q2NL68 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PROSER3Q2NL68 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PROSER3Q2NL68 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PROSER3Q2NL68 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PROSER3Q2NL68 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PROSER3Q2NL68 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PROSER3Q2NL68 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PROSER3Q2NL68 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PROSER3Q2NL68 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PROSER3Q2NL68 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PROSER3Q2NL68 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PROSER3Q2NL68 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PROSER3Q2NL68 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PROSER3Q2NL68 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
PROSER3Q2NL68 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PROSER3Q2NL68 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PROSER3Q2NL68 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PROSER3Q2NL68 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PROSER3Q2NL68 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PROSER3Q2NL68 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PROSER3Q2NL68 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PROSER3Q2NL68 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PROSER3Q2NL68 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PROSER3Q2NL68 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PROSER3Q2NL68 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PROSER3Q2NL68 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PROSER3Q2NL68 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PROSER3Q2NL68 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PROSER3Q2NL68 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PROSER3Q2NL68 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PROSER3Q2NL68 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PROSER3Q2NL68 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PROSER3Q2NL68 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PROSER3Q2NL68 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PROSER3Q2NL68 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PROSER3Q2NL68 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PROSER3Q2NL68 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PROSER3Q2NL68 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PROSER3Q2NL68 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PROSER3Q2NL68 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PROSER3Q2NL68 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PROSER3Q2NL68 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PROSER3Q2NL68 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PROSER3Q2NL68 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PROSER3Q2NL68 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PROSER3Q2NL68 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PROSER3Q2NL68 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PROSER3Q2NL68 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PROSER3Q2NL68 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PROSER3Q2NL68 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PROSER3Q2NL68 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PROSER3Q2NL68 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PROSER3Q2NL68 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PROSER3Q2NL68 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PROSER3Q2NL68 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PROSER3Q2NL68 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PROSER3Q2NL68 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PROSER3Q2NL68 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PROSER3Q2NL68 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms