Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CALCRLQ16602 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CALCRLQ16602 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CALCRLQ16602 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CALCRLQ16602 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CALCRLQ16602 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CALCRLQ16602 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CALCRLQ16602 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CALCRLQ16602 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CALCRLQ16602 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CALCRLQ16602 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CALCRLQ16602 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CALCRLQ16602 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CALCRLQ16602 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CALCRLQ16602 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CALCRLQ16602 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CALCRLQ16602 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CALCRLQ16602 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CALCRLQ16602 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CALCRLQ16602 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CALCRLQ16602 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CALCRLQ16602 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CALCRLQ16602 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CALCRLQ16602 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CALCRLQ16602 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CALCRLQ16602 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CALCRLQ16602 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CALCRLQ16602 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CALCRLQ16602 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CALCRLQ16602 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CALCRLQ16602 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CALCRLQ16602 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CALCRLQ16602 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CALCRLQ16602 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CALCRLQ16602 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CALCRLQ16602 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CALCRLQ16602 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CALCRLQ16602 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CALCRLQ16602 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CALCRLQ16602 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CALCRLQ16602 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CALCRLQ16602 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CALCRLQ16602 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CALCRLQ16602 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CALCRLQ16602 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CALCRLQ16602 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CALCRLQ16602 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CALCRLQ16602 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CALCRLQ16602 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CALCRLQ16602 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CALCRLQ16602 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CALCRLQ16602 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CALCRLQ16602 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CALCRLQ16602 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CALCRLQ16602 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CALCRLQ16602 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALCRLQ16602 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CALCRLQ16602 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CALCRLQ16602 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CALCRLQ16602 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CALCRLQ16602 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CALCRLQ16602 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CALCRLQ16602 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CALCRLQ16602 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CALCRLQ16602 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CALCRLQ16602 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CALCRLQ16602 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CALCRLQ16602 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CALCRLQ16602 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CALCRLQ16602 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CALCRLQ16602 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CALCRLQ16602 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CALCRLQ16602 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CALCRLQ16602 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CALCRLQ16602 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CALCRLQ16602 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CALCRLQ16602 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CALCRLQ16602 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CALCRLQ16602 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CALCRLQ16602 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CALCRLQ16602 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CALCRLQ16602 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CALCRLQ16602 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CALCRLQ16602 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CALCRLQ16602 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CALCRLQ16602 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALCRLQ16602 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CALCRLQ16602 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALCRLQ16602 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CALCRLQ16602 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms