Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIK4Q16099 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIK4Q16099 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIK4Q16099 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIK4Q16099 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIK4Q16099 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIK4Q16099 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIK4Q16099 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIK4Q16099 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIK4Q16099 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIK4Q16099 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIK4Q16099 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIK4Q16099 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIK4Q16099 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIK4Q16099 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIK4Q16099 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIK4Q16099 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIK4Q16099 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIK4Q16099 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIK4Q16099 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIK4Q16099 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIK4Q16099 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIK4Q16099 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIK4Q16099 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIK4Q16099 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIK4Q16099 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIK4Q16099 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GRIK4Q16099 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIK4Q16099 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIK4Q16099 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIK4Q16099 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIK4Q16099 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIK4Q16099 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIK4Q16099 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIK4Q16099 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIK4Q16099 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIK4Q16099 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIK4Q16099 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIK4Q16099 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIK4Q16099 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIK4Q16099 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GRIK4Q16099 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIK4Q16099 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIK4Q16099 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIK4Q16099 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIK4Q16099 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIK4Q16099 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIK4Q16099 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIK4Q16099 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIK4Q16099 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIK4Q16099 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIK4Q16099 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIK4Q16099 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIK4Q16099 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIK4Q16099 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIK4Q16099 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIK4Q16099 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIK4Q16099 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIK4Q16099 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIK4Q16099 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIK4Q16099 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIK4Q16099 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIK4Q16099 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIK4Q16099 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIK4Q16099 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIK4Q16099 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIK4Q16099 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIK4Q16099 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIK4Q16099 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIK4Q16099 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIK4Q16099 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIK4Q16099 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIK4Q16099 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIK4Q16099 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIK4Q16099 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIK4Q16099 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIK4Q16099 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIK4Q16099 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIK4Q16099 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GRIK4Q16099 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIK4Q16099 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIK4Q16099 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIK4Q16099 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIK4Q16099 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIK4Q16099 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIK4Q16099 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIK4Q16099 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIK4Q16099 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIK4Q16099 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIK4Q16099 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIK4Q16099 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIK4Q16099 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIK4Q16099 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIK4Q16099 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIK4Q16099 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
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