Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF1Q15637 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SF1Q15637 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF1Q15637 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SF1Q15637 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SF1Q15637 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF1Q15637 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF1Q15637 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF1Q15637 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF1Q15637 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF1Q15637 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF1Q15637 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF1Q15637 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF1Q15637 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF1Q15637 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF1Q15637 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SF1Q15637 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF1Q15637 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF1Q15637 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF1Q15637 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF1Q15637 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF1Q15637 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF1Q15637 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF1Q15637 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF1Q15637 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF1Q15637 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF1Q15637 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SF1Q15637 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF1Q15637 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF1Q15637 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF1Q15637 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SF1Q15637 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF1Q15637 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF1Q15637 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF1Q15637 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF1Q15637 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF1Q15637 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF1Q15637 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF1Q15637 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF1Q15637 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF1Q15637 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF1Q15637 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF1Q15637 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF1Q15637 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF1Q15637 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF1Q15637 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF1Q15637 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF1Q15637 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF1Q15637 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF1Q15637 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF1Q15637 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF1Q15637 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF1Q15637 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF1Q15637 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SF1Q15637 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF1Q15637 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF1Q15637 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF1Q15637 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF1Q15637 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF1Q15637 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF1Q15637 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF1Q15637 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF1Q15637 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF1Q15637 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF1Q15637 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF1Q15637 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SF1Q15637 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SF1Q15637 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF1Q15637 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF1Q15637 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF1Q15637 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF1Q15637 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF1Q15637 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF1Q15637 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF1Q15637 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SF1Q15637 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF1Q15637 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF1Q15637 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF1Q15637 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF1Q15637 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF1Q15637 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF1Q15637 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF1Q15637 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF1Q15637 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF1Q15637 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF1Q15637 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF1Q15637 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF1Q15637 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF1Q15637 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF1Q15637 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF1Q15637 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF1Q15637 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF1Q15637 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF1Q15637 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF1Q15637 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF1Q15637 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF1Q15637 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF1Q15637 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SF1Q15637 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF1Q15637 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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