Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A3R2Q15599 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A3R2Q15599 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9A3R2Q15599 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9A3R2Q15599 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A3R2Q15599 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9A3R2Q15599 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9A3R2Q15599 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9A3R2Q15599 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC9A3R2Q15599 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A3R2Q15599 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A3R2Q15599 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A3R2Q15599 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A3R2Q15599 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A3R2Q15599 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A3R2Q15599 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3R2Q15599 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3R2Q15599 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A3R2Q15599 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A3R2Q15599 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A3R2Q15599 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3R2Q15599 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3R2Q15599 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3R2Q15599 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A3R2Q15599 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A3R2Q15599 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A3R2Q15599 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A3R2Q15599 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A3R2Q15599 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A3R2Q15599 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A3R2Q15599 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A3R2Q15599 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A3R2Q15599 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A3R2Q15599 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A3R2Q15599 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A3R2Q15599 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A3R2Q15599 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A3R2Q15599 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R2Q15599 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A3R2Q15599 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R2Q15599 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R2Q15599 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R2Q15599 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A3R2Q15599 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A3R2Q15599 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R2Q15599 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R2Q15599 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3R2Q15599 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3R2Q15599 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A3R2Q15599 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A3R2Q15599 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R2Q15599 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R2Q15599 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A3R2Q15599 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R2Q15599 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R2Q15599 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R2Q15599 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R2Q15599 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R2Q15599 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R2Q15599 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3R2Q15599 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3R2Q15599 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R2Q15599 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3R2Q15599 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A3R2Q15599 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A3R2Q15599 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A3R2Q15599 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A3R2Q15599 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A3R2Q15599 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A3R2Q15599 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A3R2Q15599 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A3R2Q15599 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A3R2Q15599 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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