Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDCD11Q14690 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDCD11Q14690 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDCD11Q14690 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDCD11Q14690 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PDCD11Q14690 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDCD11Q14690 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDCD11Q14690 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDCD11Q14690 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDCD11Q14690 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDCD11Q14690 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDCD11Q14690 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDCD11Q14690 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDCD11Q14690 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDCD11Q14690 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDCD11Q14690 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDCD11Q14690 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDCD11Q14690 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDCD11Q14690 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDCD11Q14690 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDCD11Q14690 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDCD11Q14690 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDCD11Q14690 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDCD11Q14690 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDCD11Q14690 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDCD11Q14690 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDCD11Q14690 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDCD11Q14690 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDCD11Q14690 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDCD11Q14690 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDCD11Q14690 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDCD11Q14690 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDCD11Q14690 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDCD11Q14690 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDCD11Q14690 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDCD11Q14690 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDCD11Q14690 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PDCD11Q14690 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDCD11Q14690 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDCD11Q14690 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDCD11Q14690 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PDCD11Q14690 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDCD11Q14690 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDCD11Q14690 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDCD11Q14690 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDCD11Q14690 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDCD11Q14690 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDCD11Q14690 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDCD11Q14690 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDCD11Q14690 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDCD11Q14690 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PDCD11Q14690 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDCD11Q14690 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDCD11Q14690 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDCD11Q14690 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PDCD11Q14690 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDCD11Q14690 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDCD11Q14690 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDCD11Q14690 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDCD11Q14690 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDCD11Q14690 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDCD11Q14690 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDCD11Q14690 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDCD11Q14690 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDCD11Q14690 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDCD11Q14690 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDCD11Q14690 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PDCD11Q14690 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCD11Q14690 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCD11Q14690 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDCD11Q14690 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDCD11Q14690 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDCD11Q14690 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDCD11Q14690 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDCD11Q14690 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PDCD11Q14690 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDCD11Q14690 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDCD11Q14690 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDCD11Q14690 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PDCD11Q14690 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDCD11Q14690 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDCD11Q14690 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDCD11Q14690 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDCD11Q14690 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDCD11Q14690 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCD11Q14690 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDCD11Q14690 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDCD11Q14690 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDCD11Q14690 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDCD11Q14690 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDCD11Q14690 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDCD11Q14690 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDCD11Q14690 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCD11Q14690 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCD11Q14690 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDCD11Q14690 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCD11Q14690 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDCD11Q14690 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDCD11Q14690 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCD11Q14690 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
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