Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SPARCL1Q14515 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SPARCL1Q14515 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SPARCL1Q14515 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPARCL1Q14515 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPARCL1Q14515 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPARCL1Q14515 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPARCL1Q14515 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SPARCL1Q14515 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPARCL1Q14515 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SPARCL1Q14515 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPARCL1Q14515 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPARCL1Q14515 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPARCL1Q14515 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPARCL1Q14515 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPARCL1Q14515 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPARCL1Q14515 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPARCL1Q14515 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPARCL1Q14515 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPARCL1Q14515 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPARCL1Q14515 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPARCL1Q14515 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SPARCL1Q14515 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPARCL1Q14515 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SPARCL1Q14515 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SPARCL1Q14515 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPARCL1Q14515 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPARCL1Q14515 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPARCL1Q14515 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPARCL1Q14515 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPARCL1Q14515 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPARCL1Q14515 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPARCL1Q14515 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPARCL1Q14515 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SPARCL1Q14515 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SPARCL1Q14515 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SPARCL1Q14515 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SPARCL1Q14515 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPARCL1Q14515 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPARCL1Q14515 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPARCL1Q14515 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SPARCL1Q14515 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPARCL1Q14515 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPARCL1Q14515 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPARCL1Q14515 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPARCL1Q14515 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPARCL1Q14515 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPARCL1Q14515 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SPARCL1Q14515 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SPARCL1Q14515 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SPARCL1Q14515 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPARCL1Q14515 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SPARCL1Q14515 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPARCL1Q14515 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPARCL1Q14515 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPARCL1Q14515 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPARCL1Q14515 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPARCL1Q14515 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPARCL1Q14515 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPARCL1Q14515 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPARCL1Q14515 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPARCL1Q14515 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPARCL1Q14515 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPARCL1Q14515 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPARCL1Q14515 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPARCL1Q14515 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPARCL1Q14515 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPARCL1Q14515 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPARCL1Q14515 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPARCL1Q14515 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPARCL1Q14515 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPARCL1Q14515 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SPARCL1Q14515 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPARCL1Q14515 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPARCL1Q14515 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPARCL1Q14515 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPARCL1Q14515 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPARCL1Q14515 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPARCL1Q14515 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPARCL1Q14515 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPARCL1Q14515 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPARCL1Q14515 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPARCL1Q14515 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPARCL1Q14515 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPARCL1Q14515 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SPARCL1Q14515 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPARCL1Q14515 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SPARCL1Q14515 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPARCL1Q14515 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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