Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNA1CQ13936 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1CQ13936 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1CQ13936 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1CQ13936 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1CQ13936 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1CQ13936 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA1CQ13936 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA1CQ13936 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1CQ13936 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1CQ13936 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1CQ13936 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1CQ13936 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1CQ13936 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1CQ13936 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1CQ13936 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1CQ13936 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA1CQ13936 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1CQ13936 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1CQ13936 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1CQ13936 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1CQ13936 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1CQ13936 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1CQ13936 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1CQ13936 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1CQ13936 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1CQ13936 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1CQ13936 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1CQ13936 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1CQ13936 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1CQ13936 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1CQ13936 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1CQ13936 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1CQ13936 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1CQ13936 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1CQ13936 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1CQ13936 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1CQ13936 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1CQ13936 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1CQ13936 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1CQ13936 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1CQ13936 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1CQ13936 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1CQ13936 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1CQ13936 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1CQ13936 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1CQ13936 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1CQ13936 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1CQ13936 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1CQ13936 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1CQ13936 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1CQ13936 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1CQ13936 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1CQ13936 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1CQ13936 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1CQ13936 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1CQ13936 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1CQ13936 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1CQ13936 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1CQ13936 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1CQ13936 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1CQ13936 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1CQ13936 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1CQ13936 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1CQ13936 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1CQ13936 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1CQ13936 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1CQ13936 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1CQ13936 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1CQ13936 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1CQ13936 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1CQ13936 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1CQ13936 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1CQ13936 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1CQ13936 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1CQ13936 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1CQ13936 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1CQ13936 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1CQ13936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1CQ13936 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1CQ13936 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1CQ13936 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1CQ13936 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1CQ13936 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1CQ13936 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1CQ13936 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1CQ13936 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1CQ13936 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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