Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNTB1Q13884 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNTB1Q13884 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNTB1Q13884 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNTB1Q13884 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNTB1Q13884 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNTB1Q13884 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNTB1Q13884 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SNTB1Q13884 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNTB1Q13884 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNTB1Q13884 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNTB1Q13884 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNTB1Q13884 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNTB1Q13884 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNTB1Q13884 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNTB1Q13884 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SNTB1Q13884 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNTB1Q13884 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNTB1Q13884 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNTB1Q13884 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNTB1Q13884 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNTB1Q13884 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNTB1Q13884 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNTB1Q13884 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNTB1Q13884 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNTB1Q13884 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNTB1Q13884 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNTB1Q13884 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNTB1Q13884 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNTB1Q13884 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNTB1Q13884 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNTB1Q13884 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNTB1Q13884 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNTB1Q13884 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNTB1Q13884 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNTB1Q13884 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTB1Q13884 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNTB1Q13884 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNTB1Q13884 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNTB1Q13884 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNTB1Q13884 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNTB1Q13884 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNTB1Q13884 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNTB1Q13884 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNTB1Q13884 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNTB1Q13884 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNTB1Q13884 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNTB1Q13884 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNTB1Q13884 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNTB1Q13884 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNTB1Q13884 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNTB1Q13884 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNTB1Q13884 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNTB1Q13884 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNTB1Q13884 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNTB1Q13884 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNTB1Q13884 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNTB1Q13884 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNTB1Q13884 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNTB1Q13884 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNTB1Q13884 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNTB1Q13884 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNTB1Q13884 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNTB1Q13884 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNTB1Q13884 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNTB1Q13884 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNTB1Q13884 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNTB1Q13884 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNTB1Q13884 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNTB1Q13884 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNTB1Q13884 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNTB1Q13884 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNTB1Q13884 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNTB1Q13884 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNTB1Q13884 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNTB1Q13884 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNTB1Q13884 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNTB1Q13884 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNTB1Q13884 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNTB1Q13884 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTB1Q13884 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNTB1Q13884 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTB1Q13884 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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