Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BFSP2Q13515 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
BFSP2Q13515 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BFSP2Q13515 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BFSP2Q13515 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BFSP2Q13515 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BFSP2Q13515 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BFSP2Q13515 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
BFSP2Q13515 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BFSP2Q13515 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BFSP2Q13515 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BFSP2Q13515 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BFSP2Q13515 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BFSP2Q13515 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BFSP2Q13515 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BFSP2Q13515 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BFSP2Q13515 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
BFSP2Q13515 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BFSP2Q13515 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BFSP2Q13515 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BFSP2Q13515 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BFSP2Q13515 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BFSP2Q13515 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BFSP2Q13515 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BFSP2Q13515 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BFSP2Q13515 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BFSP2Q13515 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BFSP2Q13515 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BFSP2Q13515 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BFSP2Q13515 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BFSP2Q13515 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BFSP2Q13515 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BFSP2Q13515 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
BFSP2Q13515 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BFSP2Q13515 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BFSP2Q13515 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BFSP2Q13515 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BFSP2Q13515 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
BFSP2Q13515 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BFSP2Q13515 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BFSP2Q13515 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BFSP2Q13515 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BFSP2Q13515 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BFSP2Q13515 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BFSP2Q13515 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BFSP2Q13515 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BFSP2Q13515 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BFSP2Q13515 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BFSP2Q13515 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
BFSP2Q13515 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BFSP2Q13515 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BFSP2Q13515 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BFSP2Q13515 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BFSP2Q13515 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BFSP2Q13515 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BFSP2Q13515 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BFSP2Q13515 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BFSP2Q13515 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BFSP2Q13515 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BFSP2Q13515 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BFSP2Q13515 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BFSP2Q13515 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BFSP2Q13515 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BFSP2Q13515 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BFSP2Q13515 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BFSP2Q13515 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BFSP2Q13515 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BFSP2Q13515 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BFSP2Q13515 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BFSP2Q13515 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BFSP2Q13515 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BFSP2Q13515 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BFSP2Q13515 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BFSP2Q13515 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BFSP2Q13515 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BFSP2Q13515 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BFSP2Q13515 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BFSP2Q13515 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BFSP2Q13515 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BFSP2Q13515 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BFSP2Q13515 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BFSP2Q13515 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BFSP2Q13515 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BFSP2Q13515 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BFSP2Q13515 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BFSP2Q13515 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BFSP2Q13515 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BFSP2Q13515 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
BFSP2Q13515 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BFSP2Q13515 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BFSP2Q13515 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
BFSP2Q13515 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BFSP2Q13515 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
BFSP2Q13515 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
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