Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TRDNQ13061 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRDNQ13061 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TRDNQ13061 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
TRDNQ13061 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRDNQ13061 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRDNQ13061 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRDNQ13061 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRDNQ13061 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRDNQ13061 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRDNQ13061 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRDNQ13061 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRDNQ13061 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRDNQ13061 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRDNQ13061 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRDNQ13061 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRDNQ13061 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRDNQ13061 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRDNQ13061 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRDNQ13061 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRDNQ13061 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRDNQ13061 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRDNQ13061 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRDNQ13061 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRDNQ13061 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRDNQ13061 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRDNQ13061 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRDNQ13061 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRDNQ13061 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRDNQ13061 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRDNQ13061 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRDNQ13061 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRDNQ13061 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRDNQ13061 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRDNQ13061 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRDNQ13061 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRDNQ13061 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRDNQ13061 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRDNQ13061 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRDNQ13061 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRDNQ13061 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRDNQ13061 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRDNQ13061 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRDNQ13061 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRDNQ13061 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRDNQ13061 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRDNQ13061 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRDNQ13061 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRDNQ13061 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRDNQ13061 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRDNQ13061 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRDNQ13061 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRDNQ13061 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRDNQ13061 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TRDNQ13061 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRDNQ13061 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRDNQ13061 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRDNQ13061 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRDNQ13061 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRDNQ13061 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRDNQ13061 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRDNQ13061 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRDNQ13061 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRDNQ13061 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRDNQ13061 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRDNQ13061 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRDNQ13061 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRDNQ13061 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRDNQ13061 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRDNQ13061 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRDNQ13061 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRDNQ13061 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRDNQ13061 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRDNQ13061 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRDNQ13061 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRDNQ13061 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRDNQ13061 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRDNQ13061 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRDNQ13061 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRDNQ13061 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRDNQ13061 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRDNQ13061 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRDNQ13061 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRDNQ13061 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRDNQ13061 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRDNQ13061 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRDNQ13061 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRDNQ13061 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRDNQ13061 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRDNQ13061 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRDNQ13061 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRDNQ13061 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRDNQ13061 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRDNQ13061 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRDNQ13061 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
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