Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NFX1Q12986 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NFX1Q12986 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NFX1Q12986 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NFX1Q12986 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NFX1Q12986 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NFX1Q12986 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NFX1Q12986 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NFX1Q12986 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NFX1Q12986 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NFX1Q12986 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NFX1Q12986 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NFX1Q12986 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NFX1Q12986 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NFX1Q12986 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NFX1Q12986 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NFX1Q12986 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NFX1Q12986 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NFX1Q12986 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NFX1Q12986 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NFX1Q12986 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NFX1Q12986 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NFX1Q12986 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NFX1Q12986 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NFX1Q12986 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NFX1Q12986 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NFX1Q12986 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NFX1Q12986 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NFX1Q12986 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NFX1Q12986 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NFX1Q12986 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NFX1Q12986 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NFX1Q12986 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NFX1Q12986 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NFX1Q12986 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NFX1Q12986 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NFX1Q12986 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFX1Q12986 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NFX1Q12986 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NFX1Q12986 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFX1Q12986 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NFX1Q12986 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NFX1Q12986 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NFX1Q12986 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NFX1Q12986 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NFX1Q12986 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NFX1Q12986 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NFX1Q12986 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NFX1Q12986 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NFX1Q12986 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NFX1Q12986 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NFX1Q12986 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NFX1Q12986 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFX1Q12986 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NFX1Q12986 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NFX1Q12986 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NFX1Q12986 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NFX1Q12986 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NFX1Q12986 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NFX1Q12986 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFX1Q12986 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NFX1Q12986 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFX1Q12986 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFX1Q12986 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NFX1Q12986 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NFX1Q12986 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NFX1Q12986 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NFX1Q12986 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFX1Q12986 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFX1Q12986 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFX1Q12986 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFX1Q12986 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NFX1Q12986 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NFX1Q12986 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NFX1Q12986 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NFX1Q12986 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NFX1Q12986 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NFX1Q12986 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NFX1Q12986 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFX1Q12986 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NFX1Q12986 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NFX1Q12986 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFX1Q12986 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NFX1Q12986 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFX1Q12986 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NFX1Q12986 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFX1Q12986 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFX1Q12986 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFX1Q12986 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFX1Q12986 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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