Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BNIP3Q12983 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BNIP3Q12983 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BNIP3Q12983 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BNIP3Q12983 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BNIP3Q12983 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BNIP3Q12983 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BNIP3Q12983 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BNIP3Q12983 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BNIP3Q12983 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BNIP3Q12983 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BNIP3Q12983 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BNIP3Q12983 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BNIP3Q12983 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BNIP3Q12983 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BNIP3Q12983 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BNIP3Q12983 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BNIP3Q12983 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
BNIP3Q12983 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BNIP3Q12983 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BNIP3Q12983 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
BNIP3Q12983 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BNIP3Q12983 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BNIP3Q12983 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BNIP3Q12983 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BNIP3Q12983 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BNIP3Q12983 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BNIP3Q12983 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BNIP3Q12983 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BNIP3Q12983 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BNIP3Q12983 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BNIP3Q12983 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BNIP3Q12983 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BNIP3Q12983 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BNIP3Q12983 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BNIP3Q12983 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BNIP3Q12983 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BNIP3Q12983 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BNIP3Q12983 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
BNIP3Q12983 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BNIP3Q12983 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
BNIP3Q12983 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BNIP3Q12983 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BNIP3Q12983 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BNIP3Q12983 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BNIP3Q12983 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BNIP3Q12983 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BNIP3Q12983 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BNIP3Q12983 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BNIP3Q12983 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BNIP3Q12983 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BNIP3Q12983 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BNIP3Q12983 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BNIP3Q12983 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BNIP3Q12983 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BNIP3Q12983 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BNIP3Q12983 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BNIP3Q12983 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BNIP3Q12983 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BNIP3Q12983 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BNIP3Q12983 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BNIP3Q12983 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BNIP3Q12983 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BNIP3Q12983 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BNIP3Q12983 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BNIP3Q12983 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BNIP3Q12983 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BNIP3Q12983 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BNIP3Q12983 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BNIP3Q12983 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BNIP3Q12983 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BNIP3Q12983 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BNIP3Q12983 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNIP3Q12983 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNIP3Q12983 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNIP3Q12983 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BNIP3Q12983 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BNIP3Q12983 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BNIP3Q12983 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BNIP3Q12983 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BNIP3Q12983 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BNIP3Q12983 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BNIP3Q12983 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BNIP3Q12983 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BNIP3Q12983 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BNIP3Q12983 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BNIP3Q12983 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BNIP3Q12983 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BNIP3Q12983 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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