Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DSC1Q08554 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DSC1Q08554 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DSC1Q08554 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DSC1Q08554 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DSC1Q08554 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DSC1Q08554 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DSC1Q08554 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
DSC1Q08554 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DSC1Q08554 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DSC1Q08554 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DSC1Q08554 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DSC1Q08554 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DSC1Q08554 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DSC1Q08554 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
DSC1Q08554 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DSC1Q08554 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DSC1Q08554 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
DSC1Q08554 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DSC1Q08554 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DSC1Q08554 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DSC1Q08554 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DSC1Q08554 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DSC1Q08554 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DSC1Q08554 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DSC1Q08554 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DSC1Q08554 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DSC1Q08554 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DSC1Q08554 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DSC1Q08554 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DSC1Q08554 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DSC1Q08554 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DSC1Q08554 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DSC1Q08554 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DSC1Q08554 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DSC1Q08554 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DSC1Q08554 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DSC1Q08554 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DSC1Q08554 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DSC1Q08554 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DSC1Q08554 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
DSC1Q08554 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
DSC1Q08554 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DSC1Q08554 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DSC1Q08554 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DSC1Q08554 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DSC1Q08554 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DSC1Q08554 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DSC1Q08554 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DSC1Q08554 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DSC1Q08554 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DSC1Q08554 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DSC1Q08554 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DSC1Q08554 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DSC1Q08554 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DSC1Q08554 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DSC1Q08554 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DSC1Q08554 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DSC1Q08554 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DSC1Q08554 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DSC1Q08554 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DSC1Q08554 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DSC1Q08554 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
DSC1Q08554 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DSC1Q08554 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DSC1Q08554 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DSC1Q08554 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DSC1Q08554 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DSC1Q08554 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DSC1Q08554 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DSC1Q08554 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DSC1Q08554 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DSC1Q08554 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DSC1Q08554 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DSC1Q08554 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DSC1Q08554 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DSC1Q08554 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
DSC1Q08554 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DSC1Q08554 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DSC1Q08554 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DSC1Q08554 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DSC1Q08554 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DSC1Q08554 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DSC1Q08554 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DSC1Q08554 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DSC1Q08554 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DSC1Q08554 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DSC1Q08554 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms