Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MCL1Q07820 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MCL1Q07820 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MCL1Q07820 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MCL1Q07820 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MCL1Q07820 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MCL1Q07820 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MCL1Q07820 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MCL1Q07820 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MCL1Q07820 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MCL1Q07820 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MCL1Q07820 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MCL1Q07820 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MCL1Q07820 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MCL1Q07820 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MCL1Q07820 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MCL1Q07820 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MCL1Q07820 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MCL1Q07820 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MCL1Q07820 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MCL1Q07820 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MCL1Q07820 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MCL1Q07820 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MCL1Q07820 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MCL1Q07820 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MCL1Q07820 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MCL1Q07820 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MCL1Q07820 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MCL1Q07820 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MCL1Q07820 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MCL1Q07820 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MCL1Q07820 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MCL1Q07820 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MCL1Q07820 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MCL1Q07820 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MCL1Q07820 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MCL1Q07820 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MCL1Q07820 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MCL1Q07820 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MCL1Q07820 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MCL1Q07820 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MCL1Q07820 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MCL1Q07820 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MCL1Q07820 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MCL1Q07820 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MCL1Q07820 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MCL1Q07820 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
MCL1Q07820 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MCL1Q07820 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MCL1Q07820 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MCL1Q07820 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MCL1Q07820 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MCL1Q07820 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MCL1Q07820 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MCL1Q07820 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MCL1Q07820 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MCL1Q07820 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MCL1Q07820 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MCL1Q07820 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCL1Q07820 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCL1Q07820 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
MCL1Q07820 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCL1Q07820 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCL1Q07820 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCL1Q07820 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCL1Q07820 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCL1Q07820 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCL1Q07820 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCL1Q07820 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MCL1Q07820 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MCL1Q07820 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCL1Q07820 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MCL1Q07820 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MCL1Q07820 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MCL1Q07820 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCL1Q07820 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCL1Q07820 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MCL1Q07820 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MCL1Q07820 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MCL1Q07820 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCL1Q07820 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCL1Q07820 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCL1Q07820 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCL1Q07820 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MCL1Q07820 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCL1Q07820 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCL1Q07820 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCL1Q07820 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MCL1Q07820 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCL1Q07820 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MCL1Q07820 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
MCL1Q07820 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MCL1Q07820 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCL1Q07820 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms