RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439491.2

SLC29A4-205, Transcript of solute carrier family 29 member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SLC29A4, Length 805 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4-205ENST00000439491 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.58■■■■□ 3.61
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SLC29A4-205ENST00000439491 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC29A4-205ENST00000439491 NACADO15069 1562 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC29A4-205ENST00000439491 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC29A4-205ENST00000439491 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC29A4-205ENST00000439491 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC29A4-205ENST00000439491 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
SLC29A4-205ENST00000439491 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.16■■■□□ 2.58
SLC29A4-205ENST00000439491 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.01■■■□□ 2.56
SLC29A4-205ENST00000439491 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.97■■■□□ 2.55
SLC29A4-205ENST00000439491 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.543e-7■□□□□ 9.8
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SLC29A4-205ENST00000439491 SCRIBQ14160 1630 aa30.62■■■□□ 2.49
SLC29A4-205ENST00000439491 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
SLC29A4-205ENST00000439491 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC29A4-205ENST00000439491 CECR2Q9BXF3 1484 aa30■■■□□ 2.39
SLC29A4-205ENST00000439491 SMARCA4P51532 1647 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC29A4-205ENST00000439491 NCAPD3P42695 1498 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC29A4-205ENST00000439491 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.22■■■□□ 2.27
SLC29A4-205ENST00000439491 SMARCA2P51531 1590 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC29A4-205ENST00000439491 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SLC29A4-205ENST00000439491 HMGXB3Q12766 1538 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC29A4-205ENST00000439491 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC29A4-205ENST00000439491 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC29A4-205ENST00000439491 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SLC29A4-205ENST00000439491 ERCC6Q03468 1493 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC29A4-205ENST00000439491 CUX2O14529 1486 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC29A4-205ENST00000439491 NESP48681 1621 aa28.69■■■□□ 2.18
SLC29A4-205ENST00000439491 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC29A4-205ENST00000439491 WIZO95785 1651 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC29A4-205ENST00000439491 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SLC29A4-205ENST00000439491 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC29A4-205ENST00000439491 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SLC29A4-205ENST00000439491 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC29A4-205ENST00000439491 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC29A4-205ENST00000439491 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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SLC29A4-205ENST00000439491 CFTRP13569 1480 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC29A4-205ENST00000439491 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC29A4-205ENST00000439491 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC29A4-205ENST00000439491 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC29A4-205ENST00000439491 PRDM2Q13029 1718 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC29A4-205ENST00000439491 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC29A4-205ENST00000439491 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SLC29A4-205ENST00000439491 TOPBP1Q92547 1522 aa27.57■■■□□ 2
SLC29A4-205ENST00000439491 ABCC8Q09428 1581 aa27.54■■■□□ 2
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SLC29A4-205ENST00000439491 IFT140Q96RY7 1462 aa27.51■■■□□ 2
SLC29A4-205ENST00000439491 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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SLC29A4-205ENST00000439491 CUX1P39880 1505 aa27.19■■□□□ 1.94
SLC29A4-205ENST00000439491 WDR97A6NE52 1622 aa27.18■■□□□ 1.94
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SLC29A4-205ENST00000439491 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC29A4-205ENST00000439491 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC29A4-205ENST00000439491 CHD1O14646 1710 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC29A4-205ENST00000439491 SOGA1O94964 1423 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC29A4-205ENST00000439491 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SLC29A4-205ENST00000439491 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC29A4-205ENST00000439491 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC29A4-205ENST00000439491 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC29A4-205ENST00000439491 TRIM41Q8WV44 630 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC29A4-205ENST00000439491 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SLC29A4-205ENST00000439491 ARHGEF11O15085 1522 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC29A4-205ENST00000439491 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 GRIN2BQ13224 1484 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 PBRM1Q86U86 1689 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC29A4-205ENST00000439491 TOP2BQ02880 1626 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC29A4-205ENST00000439491 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC29A4-205ENST00000439491 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC29A4-205ENST00000439491 SYNJ2O15056 1496 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC29A4-205ENST00000439491 SYNJ1O43426 1573 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC29A4-205ENST00000439491 FBLN2P98095 1184 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC29A4-205ENST00000439491 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
SLC29A4-205ENST00000439491 ARAP1Q96P48 1450 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC29A4-205ENST00000439491 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC29A4-205ENST00000439491 ADAMTS12P58397 1594 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC29A4-205ENST00000439491 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC29A4-205ENST00000439491 GRIN2AQ12879 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC29A4-205ENST00000439491 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC29A4-205ENST00000439491 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 NUP160Q12769 1436 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 SHROOM2Q13796 1616 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC29A4-205ENST00000439491 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC29A4-205ENST00000439491 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC29A4-205ENST00000439491 CUL7Q14999 1698 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC29A4-205ENST00000439491 KIF27Q86VH2 1401 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC29A4-205ENST00000439491 IGF1RP08069 1367 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC29A4-205ENST00000439491 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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