RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.27■■■■■ 4.2
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.77■■■■□ 3.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCC9O60706 1549 aa36.1■■■■□ 3.37
KCNQ1-205ENST00000496887 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.66■■■■□ 3.14
KCNQ1-205ENST00000496887 NACADO15069 1562 aa34.57■■■■□ 3.13
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.56■■■■□ 3.12
KCNQ1-205ENST00000496887 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.29■■■■□ 3.08
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.11■■■■□ 3.05
KCNQ1-205ENST00000496887 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.96■■■■□ 3.03
KCNQ1-205ENST00000496887 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
KCNQ1-205ENST00000496887 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.64■■■□□ 2.98
KCNQ1-205ENST00000496887 SCRIBQ14160 1630 aa33.56■■■□□ 2.96
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.26■■■□□ 2.91
KCNQ1-205ENST00000496887 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
KCNQ1-205ENST00000496887 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.66■■■□□ 2.82
KCNQ1-205ENST00000496887 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.43■■■□□ 2.78
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCA4P51532 1647 aa32.07■■■□□ 2.72
KCNQ1-205ENST00000496887 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
KCNQ1-205ENST00000496887 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.9■■■□□ 2.7
KCNQ1-205ENST00000496887 NCAPD3P42695 1498 aa31.89■■■□□ 2.7
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
KCNQ1-205ENST00000496887 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
KCNQ1-205ENST00000496887 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.73■■■□□ 2.67
KCNQ1-205ENST00000496887 HMGXB3Q12766 1538 aa31.73■■■□□ 2.67
KCNQ1-205ENST00000496887 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
KCNQ1-205ENST00000496887 WIZO95785 1651 aa31.5■■■□□ 2.63
KCNQ1-205ENST00000496887 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
KCNQ1-205ENST00000496887 NESP48681 1621 aa31.2■■■□□ 2.59
KCNQ1-205ENST00000496887 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
KCNQ1-205ENST00000496887 ERCC6Q03468 1493 aa31.11■■■□□ 2.57
KCNQ1-205ENST00000496887 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.09■■■□□ 2.57
KCNQ1-205ENST00000496887 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.95■■■□□ 2.55
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.88■■■□□ 2.53
KCNQ1-205ENST00000496887 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.86■■■□□ 2.53
KCNQ1-205ENST00000496887 CUX2O14529 1486 aa30.8■■■□□ 2.52
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.76■■■□□ 2.52
KCNQ1-205ENST00000496887 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
KCNQ1-205ENST00000496887 CFTRP13569 1480 aa30.74■■■□□ 2.51
KCNQ1-205ENST00000496887 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.62■■■□□ 2.49
KCNQ1-205ENST00000496887 PRDM2Q13029 1718 aa30.59■■■□□ 2.49
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.58■■■□□ 2.49
KCNQ1-205ENST00000496887 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.57■■■□□ 2.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR62O43379 1518 aa30.47■■■□□ 2.47
KCNQ1-205ENST00000496887 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TOPBP1Q92547 1522 aa30.12■■■□□ 2.41
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCC8Q09428 1581 aa30.08■■■□□ 2.41
KCNQ1-205ENST00000496887 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.03■■■□□ 2.4
KCNQ1-205ENST00000496887 IFT140Q96RY7 1462 aa29.93■■■□□ 2.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CUX1P39880 1505 aa29.86■■■□□ 2.37
KCNQ1-205ENST00000496887 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
KCNQ1-205ENST00000496887 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
KCNQ1-205ENST00000496887 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
KCNQ1-205ENST00000496887 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.74■■■□□ 2.35
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SOGA1O94964 1423 aa29.73■■■□□ 2.35
KCNQ1-205ENST00000496887 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
KCNQ1-205ENST00000496887 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
KCNQ1-205ENST00000496887 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
KCNQ1-205ENST00000496887 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.58■■■□□ 2.33
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNJ1O43426 1573 aa29.56■■■□□ 2.32
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TOP2BQ02880 1626 aa29.56■■■□□ 2.32
KCNQ1-205ENST00000496887 OSCARQ8IYS5 282 aa29.51■■■□□ 2.31
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.45■■■□□ 2.31
KCNQ1-205ENST00000496887 CHD1O14646 1710 aa29.42■■■□□ 2.3
KCNQ1-205ENST00000496887 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIN2BQ13224 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.37■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.37■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 FBLN2P98095 1184 aa29.33■■■□□ 2.29
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
KCNQ1-205ENST00000496887 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNJ2O15056 1496 aa29.21■■■□□ 2.27
KCNQ1-205ENST00000496887 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ADAMTS12P58397 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGEF11O15085 1522 aa29.05■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.04■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM41Q8WV44 630 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIN2AQ12879 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF27Q86VH2 1401 aa28.98■■■□□ 2.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP170Q5SW79 1584 aa28.9■■■□□ 2.22
KCNQ1-205ENST00000496887 IGF1RP08069 1367 aa28.88■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP160Q12769 1436 aa28.87■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 CUL7Q14999 1698 aa28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 ARAP1Q96P48 1450 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNQ1-205ENST00000496887 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.8■■■□□ 2.2
KCNQ1-205ENST00000496887 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.73■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 SHROOM2Q13796 1616 aa28.71■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.71■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms