Protein–RNA interactions for Protein: P61647

ST8SIA6, Alpha-2,8-sialyltransferase 8F, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA6P61647 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ST8SIA6P61647 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ST8SIA6P61647 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ST8SIA6P61647 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ST8SIA6P61647 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ST8SIA6P61647 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ST8SIA6P61647 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ST8SIA6P61647 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ST8SIA6P61647 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ST8SIA6P61647 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ST8SIA6P61647 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ST8SIA6P61647 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ST8SIA6P61647 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ST8SIA6P61647 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ST8SIA6P61647 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ST8SIA6P61647 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ST8SIA6P61647 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ST8SIA6P61647 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ST8SIA6P61647 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ST8SIA6P61647 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ST8SIA6P61647 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ST8SIA6P61647 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ST8SIA6P61647 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ST8SIA6P61647 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ST8SIA6P61647 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ST8SIA6P61647 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ST8SIA6P61647 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ST8SIA6P61647 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ST8SIA6P61647 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ST8SIA6P61647 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ST8SIA6P61647 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ST8SIA6P61647 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ST8SIA6P61647 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ST8SIA6P61647 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ST8SIA6P61647 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ST8SIA6P61647 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ST8SIA6P61647 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ST8SIA6P61647 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ST8SIA6P61647 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ST8SIA6P61647 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ST8SIA6P61647 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ST8SIA6P61647 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ST8SIA6P61647 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ST8SIA6P61647 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ST8SIA6P61647 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ST8SIA6P61647 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ST8SIA6P61647 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ST8SIA6P61647 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ST8SIA6P61647 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ST8SIA6P61647 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ST8SIA6P61647 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ST8SIA6P61647 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ST8SIA6P61647 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ST8SIA6P61647 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ST8SIA6P61647 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ST8SIA6P61647 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ST8SIA6P61647 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ST8SIA6P61647 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ST8SIA6P61647 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ST8SIA6P61647 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ST8SIA6P61647 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ST8SIA6P61647 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ST8SIA6P61647 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ST8SIA6P61647 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ST8SIA6P61647 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ST8SIA6P61647 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ST8SIA6P61647 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ST8SIA6P61647 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ST8SIA6P61647 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ST8SIA6P61647 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ST8SIA6P61647 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ST8SIA6P61647 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ST8SIA6P61647 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ST8SIA6P61647 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ST8SIA6P61647 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ST8SIA6P61647 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ST8SIA6P61647 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ST8SIA6P61647 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ST8SIA6P61647 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ST8SIA6P61647 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ST8SIA6P61647 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ST8SIA6P61647 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ST8SIA6P61647 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ST8SIA6P61647 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ST8SIA6P61647 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ST8SIA6P61647 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ST8SIA6P61647 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms