Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
EIF4A1P60842 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
EIF4A1P60842 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
EIF4A1P60842 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
EIF4A1P60842 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
EIF4A1P60842 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
EIF4A1P60842 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EIF4A1P60842 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
EIF4A1P60842 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
EIF4A1P60842 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
EIF4A1P60842 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
EIF4A1P60842 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
EIF4A1P60842 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
EIF4A1P60842 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
EIF4A1P60842 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
EIF4A1P60842 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
EIF4A1P60842 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
EIF4A1P60842 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
EIF4A1P60842 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
EIF4A1P60842 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
EIF4A1P60842 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
EIF4A1P60842 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
EIF4A1P60842 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
EIF4A1P60842 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
EIF4A1P60842 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
EIF4A1P60842 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
EIF4A1P60842 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
EIF4A1P60842 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
EIF4A1P60842 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
EIF4A1P60842 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
EIF4A1P60842 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
EIF4A1P60842 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
EIF4A1P60842 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
EIF4A1P60842 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
EIF4A1P60842 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
EIF4A1P60842 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
EIF4A1P60842 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
EIF4A1P60842 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
EIF4A1P60842 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
EIF4A1P60842 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
EIF4A1P60842 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
EIF4A1P60842 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
EIF4A1P60842 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
EIF4A1P60842 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
EIF4A1P60842 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
EIF4A1P60842 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
EIF4A1P60842 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
EIF4A1P60842 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
EIF4A1P60842 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
EIF4A1P60842 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
EIF4A1P60842 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
EIF4A1P60842 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
EIF4A1P60842 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EIF4A1P60842 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
EIF4A1P60842 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
EIF4A1P60842 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
EIF4A1P60842 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
EIF4A1P60842 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
EIF4A1P60842 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
EIF4A1P60842 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
EIF4A1P60842 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
EIF4A1P60842 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
EIF4A1P60842 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
EIF4A1P60842 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
EIF4A1P60842 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
EIF4A1P60842 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
EIF4A1P60842 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
EIF4A1P60842 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
EIF4A1P60842 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
EIF4A1P60842 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
EIF4A1P60842 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
EIF4A1P60842 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
EIF4A1P60842 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
EIF4A1P60842 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EIF4A1P60842 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EIF4A1P60842 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
EIF4A1P60842 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
EIF4A1P60842 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
EIF4A1P60842 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
EIF4A1P60842 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EIF4A1P60842 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
EIF4A1P60842 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
EIF4A1P60842 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
EIF4A1P60842 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
EIF4A1P60842 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
EIF4A1P60842 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
EIF4A1P60842 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
EIF4A1P60842 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
EIF4A1P60842 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
EIF4A1P60842 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
EIF4A1P60842 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
EIF4A1P60842 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
EIF4A1P60842 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
EIF4A1P60842 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms