Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PPP4CP60510 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PPP4CP60510 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PPP4CP60510 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
PPP4CP60510 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PPP4CP60510 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PPP4CP60510 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
PPP4CP60510 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PPP4CP60510 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PPP4CP60510 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PPP4CP60510 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PPP4CP60510 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PPP4CP60510 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PPP4CP60510 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PPP4CP60510 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PPP4CP60510 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPP4CP60510 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPP4CP60510 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PPP4CP60510 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPP4CP60510 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPP4CP60510 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP4CP60510 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP4CP60510 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP4CP60510 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPP4CP60510 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PPP4CP60510 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PPP4CP60510 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PPP4CP60510 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPP4CP60510 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPP4CP60510 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPP4CP60510 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPP4CP60510 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPP4CP60510 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPP4CP60510 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPP4CP60510 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPP4CP60510 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPP4CP60510 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPP4CP60510 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PPP4CP60510 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPP4CP60510 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PPP4CP60510 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPP4CP60510 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PPP4CP60510 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPP4CP60510 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPP4CP60510 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PPP4CP60510 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPP4CP60510 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PPP4CP60510 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPP4CP60510 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPP4CP60510 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPP4CP60510 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPP4CP60510 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPP4CP60510 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPP4CP60510 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPP4CP60510 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPP4CP60510 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPP4CP60510 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPP4CP60510 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPP4CP60510 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPP4CP60510 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPP4CP60510 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPP4CP60510 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPP4CP60510 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPP4CP60510 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PPP4CP60510 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PPP4CP60510 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPP4CP60510 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP4CP60510 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPP4CP60510 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP4CP60510 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPP4CP60510 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PPP4CP60510 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPP4CP60510 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPP4CP60510 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPP4CP60510 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPP4CP60510 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPP4CP60510 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPP4CP60510 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPP4CP60510 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PPP4CP60510 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPP4CP60510 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPP4CP60510 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPP4CP60510 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPP4CP60510 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPP4CP60510 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPP4CP60510 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPP4CP60510 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPP4CP60510 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP4CP60510 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP4CP60510 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PPP4CP60510 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PPP4CP60510 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPP4CP60510 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPP4CP60510 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPP4CP60510 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms