Protein–RNA interactions for Protein: P60369

KRTAP10-3, Keratin-associated protein 10-3, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-3P60369 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRTAP10-3P60369 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRTAP10-3P60369 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRTAP10-3P60369 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRTAP10-3P60369 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRTAP10-3P60369 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRTAP10-3P60369 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRTAP10-3P60369 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRTAP10-3P60369 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRTAP10-3P60369 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRTAP10-3P60369 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRTAP10-3P60369 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRTAP10-3P60369 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRTAP10-3P60369 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRTAP10-3P60369 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRTAP10-3P60369 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRTAP10-3P60369 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRTAP10-3P60369 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP10-3P60369 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRTAP10-3P60369 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP10-3P60369 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRTAP10-3P60369 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRTAP10-3P60369 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRTAP10-3P60369 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRTAP10-3P60369 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRTAP10-3P60369 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRTAP10-3P60369 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRTAP10-3P60369 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP10-3P60369 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP10-3P60369 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTAP10-3P60369 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTAP10-3P60369 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRTAP10-3P60369 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP10-3P60369 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTAP10-3P60369 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTAP10-3P60369 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRTAP10-3P60369 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRTAP10-3P60369 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP10-3P60369 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP10-3P60369 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP10-3P60369 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTAP10-3P60369 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRTAP10-3P60369 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP10-3P60369 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRTAP10-3P60369 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRTAP10-3P60369 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP10-3P60369 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRTAP10-3P60369 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRTAP10-3P60369 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRTAP10-3P60369 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP10-3P60369 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP10-3P60369 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP10-3P60369 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP10-3P60369 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP10-3P60369 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP10-3P60369 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP10-3P60369 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP10-3P60369 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRTAP10-3P60369 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-3P60369 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-3P60369 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-3P60369 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-3P60369 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP10-3P60369 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP10-3P60369 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-3P60369 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-3P60369 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP10-3P60369 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP10-3P60369 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP10-3P60369 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-3P60369 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-3P60369 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-3P60369 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-3P60369 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP10-3P60369 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP10-3P60369 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP10-3P60369 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP10-3P60369 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP10-3P60369 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-3P60369 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP10-3P60369 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-3P60369 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP10-3P60369 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms