Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLDN18P56856 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLDN18P56856 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLDN18P56856 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLDN18P56856 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLDN18P56856 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLDN18P56856 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLDN18P56856 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLDN18P56856 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN18P56856 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLDN18P56856 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLDN18P56856 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN18P56856 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLDN18P56856 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLDN18P56856 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLDN18P56856 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLDN18P56856 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLDN18P56856 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLDN18P56856 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN18P56856 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN18P56856 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN18P56856 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDN18P56856 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDN18P56856 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDN18P56856 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDN18P56856 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLDN18P56856 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN18P56856 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN18P56856 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDN18P56856 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN18P56856 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN18P56856 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN18P56856 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN18P56856 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN18P56856 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN18P56856 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLDN18P56856 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN18P56856 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN18P56856 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN18P56856 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN18P56856 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN18P56856 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN18P56856 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN18P56856 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN18P56856 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN18P56856 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN18P56856 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN18P56856 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN18P56856 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN18P56856 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN18P56856 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN18P56856 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN18P56856 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN18P56856 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN18P56856 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN18P56856 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN18P56856 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN18P56856 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN18P56856 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN18P56856 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN18P56856 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN18P56856 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN18P56856 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN18P56856 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN18P56856 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN18P56856 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN18P56856 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN18P56856 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN18P56856 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN18P56856 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN18P56856 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN18P56856 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN18P56856 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN18P56856 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN18P56856 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN18P56856 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN18P56856 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN18P56856 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDN18P56856 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDN18P56856 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN18P56856 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN18P56856 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN18P56856 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN18P56856 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDN18P56856 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN18P56856 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN18P56856 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN18P56856 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN18P56856 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN18P56856 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN18P56856 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN18P56856 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN18P56856 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN18P56856 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN18P56856 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.5 ms