Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDDM3BP56851 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDDM3BP56851 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDDM3BP56851 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDDM3BP56851 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDDM3BP56851 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDDM3BP56851 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDDM3BP56851 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDDM3BP56851 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDDM3BP56851 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDDM3BP56851 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDDM3BP56851 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDDM3BP56851 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDDM3BP56851 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDDM3BP56851 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDDM3BP56851 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDDM3BP56851 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDDM3BP56851 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDDM3BP56851 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDDM3BP56851 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDDM3BP56851 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDDM3BP56851 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDDM3BP56851 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDDM3BP56851 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDDM3BP56851 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDDM3BP56851 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDDM3BP56851 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDDM3BP56851 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDDM3BP56851 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDDM3BP56851 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDDM3BP56851 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDDM3BP56851 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDDM3BP56851 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDDM3BP56851 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDDM3BP56851 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDDM3BP56851 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDDM3BP56851 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDDM3BP56851 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDDM3BP56851 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDDM3BP56851 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDDM3BP56851 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDDM3BP56851 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDDM3BP56851 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDDM3BP56851 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDDM3BP56851 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDDM3BP56851 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDDM3BP56851 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDDM3BP56851 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDDM3BP56851 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDDM3BP56851 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDDM3BP56851 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDDM3BP56851 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDDM3BP56851 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDDM3BP56851 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDDM3BP56851 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDDM3BP56851 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDDM3BP56851 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDDM3BP56851 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDDM3BP56851 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EDDM3BP56851 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDDM3BP56851 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDDM3BP56851 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDDM3BP56851 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDDM3BP56851 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDDM3BP56851 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDDM3BP56851 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDDM3BP56851 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDDM3BP56851 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDDM3BP56851 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDDM3BP56851 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDDM3BP56851 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDDM3BP56851 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDDM3BP56851 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDDM3BP56851 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDDM3BP56851 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDDM3BP56851 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDDM3BP56851 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDDM3BP56851 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDDM3BP56851 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDDM3BP56851 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDDM3BP56851 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDDM3BP56851 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDDM3BP56851 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms