Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAV3P56539 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAV3P56539 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAV3P56539 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAV3P56539 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAV3P56539 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAV3P56539 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAV3P56539 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAV3P56539 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAV3P56539 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAV3P56539 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAV3P56539 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAV3P56539 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAV3P56539 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAV3P56539 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAV3P56539 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAV3P56539 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAV3P56539 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAV3P56539 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAV3P56539 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAV3P56539 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV3P56539 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV3P56539 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV3P56539 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAV3P56539 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAV3P56539 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAV3P56539 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAV3P56539 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAV3P56539 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAV3P56539 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAV3P56539 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAV3P56539 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV3P56539 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAV3P56539 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAV3P56539 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAV3P56539 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAV3P56539 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAV3P56539 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAV3P56539 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAV3P56539 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAV3P56539 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAV3P56539 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAV3P56539 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAV3P56539 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV3P56539 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAV3P56539 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAV3P56539 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAV3P56539 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAV3P56539 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAV3P56539 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAV3P56539 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAV3P56539 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAV3P56539 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAV3P56539 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAV3P56539 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAV3P56539 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAV3P56539 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAV3P56539 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAV3P56539 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAV3P56539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAV3P56539 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAV3P56539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAV3P56539 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAV3P56539 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAV3P56539 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAV3P56539 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAV3P56539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAV3P56539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAV3P56539 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAV3P56539 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAV3P56539 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAV3P56539 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAV3P56539 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV3P56539 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV3P56539 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAV3P56539 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAV3P56539 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAV3P56539 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAV3P56539 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAV3P56539 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAV3P56539 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAV3P56539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAV3P56539 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAV3P56539 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAV3P56539 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAV3P56539 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV3P56539 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV3P56539 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV3P56539 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV3P56539 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAV3P56539 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAV3P56539 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAV3P56539 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV3P56539 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV3P56539 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV3P56539 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV3P56539 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAV3P56539 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAV3P56539 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAV3P56539 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms