Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NCKAP1LP55160 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCKAP1LP55160 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCKAP1LP55160 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCKAP1LP55160 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCKAP1LP55160 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCKAP1LP55160 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCKAP1LP55160 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCKAP1LP55160 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCKAP1LP55160 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NCKAP1LP55160 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCKAP1LP55160 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCKAP1LP55160 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCKAP1LP55160 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCKAP1LP55160 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCKAP1LP55160 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCKAP1LP55160 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCKAP1LP55160 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCKAP1LP55160 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCKAP1LP55160 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCKAP1LP55160 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCKAP1LP55160 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCKAP1LP55160 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCKAP1LP55160 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCKAP1LP55160 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCKAP1LP55160 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCKAP1LP55160 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCKAP1LP55160 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCKAP1LP55160 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCKAP1LP55160 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCKAP1LP55160 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCKAP1LP55160 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCKAP1LP55160 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCKAP1LP55160 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCKAP1LP55160 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCKAP1LP55160 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCKAP1LP55160 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCKAP1LP55160 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCKAP1LP55160 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCKAP1LP55160 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCKAP1LP55160 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCKAP1LP55160 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCKAP1LP55160 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCKAP1LP55160 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCKAP1LP55160 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NCKAP1LP55160 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCKAP1LP55160 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCKAP1LP55160 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCKAP1LP55160 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCKAP1LP55160 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NCKAP1LP55160 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NCKAP1LP55160 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCKAP1LP55160 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCKAP1LP55160 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCKAP1LP55160 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCKAP1LP55160 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCKAP1LP55160 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCKAP1LP55160 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCKAP1LP55160 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NCKAP1LP55160 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NCKAP1LP55160 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCKAP1LP55160 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCKAP1LP55160 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCKAP1LP55160 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCKAP1LP55160 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCKAP1LP55160 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCKAP1LP55160 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCKAP1LP55160 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCKAP1LP55160 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NCKAP1LP55160 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCKAP1LP55160 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCKAP1LP55160 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCKAP1LP55160 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCKAP1LP55160 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCKAP1LP55160 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCKAP1LP55160 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCKAP1LP55160 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCKAP1LP55160 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCKAP1LP55160 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCKAP1LP55160 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCKAP1LP55160 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCKAP1LP55160 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCKAP1LP55160 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCKAP1LP55160 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCKAP1LP55160 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCKAP1LP55160 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCKAP1LP55160 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCKAP1LP55160 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCKAP1LP55160 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms