RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494290.1

GRHPR-209, Transcript of glyoxylate and hydroxypyruvate reductase, humanhuman

TSL 5

Gene GRHPR, Length 1,593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHPR-209ENST00000494290 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.3■■■■□ 3.08
GRHPR-209ENST00000494290 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.16■■■□□ 2.42
GRHPR-209ENST00000494290 ABCC9O60706 1549 aa30.13■■■□□ 2.41
GRHPR-209ENST00000494290 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GRHPR-209ENST00000494290 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.66■■■□□ 2.18
GRHPR-209ENST00000494290 NACADO15069 1562 aa28.45■■■□□ 2.14
GRHPR-209ENST00000494290 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.43■■■□□ 2.14
GRHPR-209ENST00000494290 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.4■■■□□ 2.14
GRHPR-209ENST00000494290 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.24■■■□□ 2.11
GRHPR-209ENST00000494290 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.24■■■□□ 2.11
GRHPR-209ENST00000494290 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.2■■■□□ 2.11
GRHPR-209ENST00000494290 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.96■■■□□ 2.07
GRHPR-209ENST00000494290 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
GRHPR-209ENST00000494290 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.66■■■□□ 2.02
GRHPR-209ENST00000494290 SCRIBQ14160 1630 aa27.55■■■□□ 2
GRHPR-209ENST00000494290 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.3■■□□□ 1.96
GRHPR-209ENST00000494290 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
GRHPR-209ENST00000494290 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.15■■□□□ 1.94
GRHPR-209ENST00000494290 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GRHPR-209ENST00000494290 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GRHPR-209ENST00000494290 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GRHPR-209ENST00000494290 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.46■■□□□ 1.83
GRHPR-209ENST00000494290 SMARCA4P51532 1647 aa26.44■■□□□ 1.82
GRHPR-209ENST00000494290 NCAPD3P42695 1498 aa26.25■■□□□ 1.79
GRHPR-209ENST00000494290 WIZO95785 1651 aa26.24■■□□□ 1.79
GRHPR-209ENST00000494290 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.16■■□□□ 1.78
GRHPR-209ENST00000494290 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.16■■□□□ 1.78
GRHPR-209ENST00000494290 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.11■■□□□ 1.77
GRHPR-209ENST00000494290 HMGXB3Q12766 1538 aa26.09■■□□□ 1.77
GRHPR-209ENST00000494290 SMARCA2P51531 1590 aa26.06■■□□□ 1.76
GRHPR-209ENST00000494290 CUX2O14529 1486 aa26.05■■□□□ 1.76
GRHPR-209ENST00000494290 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GRHPR-209ENST00000494290 ERCC6Q03468 1493 aa25.95■■□□□ 1.75
GRHPR-209ENST00000494290 NESP48681 1621 aa25.9■■□□□ 1.74
GRHPR-209ENST00000494290 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GRHPR-209ENST00000494290 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
GRHPR-209ENST00000494290 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.71■■□□□ 1.71
GRHPR-209ENST00000494290 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.68■■□□□ 1.7
GRHPR-209ENST00000494290 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.66■■□□□ 1.7
GRHPR-209ENST00000494290 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.45■■□□□ 1.66
GRHPR-209ENST00000494290 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.39■■□□□ 1.65
GRHPR-209ENST00000494290 WDR62O43379 1518 aa25.32■■□□□ 1.64
GRHPR-209ENST00000494290 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.3■■□□□ 1.64
GRHPR-209ENST00000494290 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.27■■□□□ 1.64
GRHPR-209ENST00000494290 CFTRP13569 1480 aa25.23■■□□□ 1.63
GRHPR-209ENST00000494290 PRDM2Q13029 1718 aa25.17■■□□□ 1.62
GRHPR-209ENST00000494290 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.16■■□□□ 1.62
GRHPR-209ENST00000494290 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.13■■□□□ 1.61
GRHPR-209ENST00000494290 ABCC8Q09428 1581 aa25.04■■□□□ 1.6
GRHPR-209ENST00000494290 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GRHPR-209ENST00000494290 TRIM41Q8WV44 630 aa24.97■■□□□ 1.59
GRHPR-209ENST00000494290 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
GRHPR-209ENST00000494290 SYNJ1O43426 1573 aa24.86■■□□□ 1.57
GRHPR-209ENST00000494290 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.82■■□□□ 1.56
GRHPR-209ENST00000494290 TOP2BQ02880 1626 aa24.81■■□□□ 1.56
GRHPR-209ENST00000494290 CUX1P39880 1505 aa24.77■■□□□ 1.56
GRHPR-209ENST00000494290 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GRHPR-209ENST00000494290 OSCARQ8IYS5 282 aa24.68■■□□□ 1.54
GRHPR-209ENST00000494290 TOPBP1Q92547 1522 aa24.68■■□□□ 1.54
GRHPR-209ENST00000494290 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.67■■□□□ 1.54
GRHPR-209ENST00000494290 IFT140Q96RY7 1462 aa24.66■■□□□ 1.54
GRHPR-209ENST00000494290 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GRHPR-209ENST00000494290 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.59■■□□□ 1.53
GRHPR-209ENST00000494290 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.59■■□□□ 1.53
GRHPR-209ENST00000494290 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.59■■□□□ 1.53
GRHPR-209ENST00000494290 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GRHPR-209ENST00000494290 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.53■■□□□ 1.52
GRHPR-209ENST00000494290 SOGA1O94964 1423 aa24.5■■□□□ 1.51
GRHPR-209ENST00000494290 EEA1Q15075 1411 aa24.5■■□□□ 1.51
GRHPR-209ENST00000494290 CHD1O14646 1710 aa24.48■■□□□ 1.51
GRHPR-209ENST00000494290 ARHGEF11O15085 1522 aa24.46■■□□□ 1.51
GRHPR-209ENST00000494290 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GRHPR-209ENST00000494290 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GRHPR-209ENST00000494290 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.42■■□□□ 1.5
GRHPR-209ENST00000494290 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 23.2
GRHPR-209ENST00000494290 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.35■■□□□ 1.49
GRHPR-209ENST00000494290 KIF27Q86VH2 1401 aa24.34■■□□□ 1.49
GRHPR-209ENST00000494290 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.33■■□□□ 1.49
GRHPR-209ENST00000494290 WDR97A6NE52 1622 aa24.33■■□□□ 1.48
GRHPR-209ENST00000494290 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.31■■□□□ 1.48
GRHPR-209ENST00000494290 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.23■■□□□ 1.47
GRHPR-209ENST00000494290 ARAP1Q96P48 1450 aa24.23■■□□□ 1.47
GRHPR-209ENST00000494290 KIF21BO75037 1637 aa24.21■■□□□ 1.47
GRHPR-209ENST00000494290 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.19■■□□□ 1.46
GRHPR-209ENST00000494290 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GRHPR-209ENST00000494290 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.17■■□□□ 1.46
GRHPR-209ENST00000494290 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.16■■□□□ 1.46
GRHPR-209ENST00000494290 GOLGA3Q08378 1498 aa24.13■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.12■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 PRXQ9BXM0 1461 aa24.12■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 IGF1RP08069 1367 aa24.12■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 PBRM1Q86U86 1689 aa24.1■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.1■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 FBLN2P98095 1184 aa24.08■■□□□ 1.45
GRHPR-209ENST00000494290 CUL7Q14999 1698 aa24.06■■□□□ 1.44
GRHPR-209ENST00000494290 GRIN2BQ13224 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
GRHPR-209ENST00000494290 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.04■■□□□ 1.44
GRHPR-209ENST00000494290 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.04■■□□□ 1.44
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