Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RCAN1P53805 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RCAN1P53805 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
RCAN1P53805 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RCAN1P53805 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RCAN1P53805 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RCAN1P53805 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RCAN1P53805 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RCAN1P53805 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RCAN1P53805 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RCAN1P53805 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RCAN1P53805 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RCAN1P53805 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RCAN1P53805 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RCAN1P53805 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RCAN1P53805 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RCAN1P53805 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RCAN1P53805 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RCAN1P53805 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RCAN1P53805 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RCAN1P53805 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RCAN1P53805 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RCAN1P53805 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RCAN1P53805 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RCAN1P53805 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RCAN1P53805 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RCAN1P53805 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RCAN1P53805 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RCAN1P53805 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RCAN1P53805 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RCAN1P53805 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RCAN1P53805 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RCAN1P53805 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RCAN1P53805 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RCAN1P53805 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RCAN1P53805 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RCAN1P53805 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RCAN1P53805 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RCAN1P53805 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RCAN1P53805 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RCAN1P53805 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RCAN1P53805 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RCAN1P53805 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RCAN1P53805 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RCAN1P53805 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RCAN1P53805 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RCAN1P53805 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RCAN1P53805 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RCAN1P53805 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RCAN1P53805 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RCAN1P53805 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RCAN1P53805 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RCAN1P53805 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RCAN1P53805 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RCAN1P53805 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RCAN1P53805 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
RCAN1P53805 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RCAN1P53805 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RCAN1P53805 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RCAN1P53805 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RCAN1P53805 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RCAN1P53805 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RCAN1P53805 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RCAN1P53805 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RCAN1P53805 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RCAN1P53805 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RCAN1P53805 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RCAN1P53805 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RCAN1P53805 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RCAN1P53805 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RCAN1P53805 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RCAN1P53805 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RCAN1P53805 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RCAN1P53805 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
RCAN1P53805 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RCAN1P53805 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RCAN1P53805 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RCAN1P53805 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RCAN1P53805 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RCAN1P53805 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RCAN1P53805 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RCAN1P53805 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RCAN1P53805 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RCAN1P53805 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RCAN1P53805 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RCAN1P53805 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RCAN1P53805 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RCAN1P53805 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RCAN1P53805 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RCAN1P53805 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RCAN1P53805 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RCAN1P53805 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RCAN1P53805 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RCAN1P53805 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RCAN1P53805 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms