Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLXNA3P51805 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNA3P51805 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PLXNA3P51805 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PLXNA3P51805 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PLXNA3P51805 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PLXNA3P51805 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PLXNA3P51805 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PLXNA3P51805 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PLXNA3P51805 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PLXNA3P51805 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PLXNA3P51805 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLXNA3P51805 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PLXNA3P51805 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PLXNA3P51805 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLXNA3P51805 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PLXNA3P51805 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLXNA3P51805 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNA3P51805 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLXNA3P51805 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLXNA3P51805 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNA3P51805 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNA3P51805 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNA3P51805 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNA3P51805 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLXNA3P51805 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLXNA3P51805 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLXNA3P51805 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PLXNA3P51805 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PLXNA3P51805 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PLXNA3P51805 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PLXNA3P51805 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PLXNA3P51805 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLXNA3P51805 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PLXNA3P51805 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLXNA3P51805 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PLXNA3P51805 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLXNA3P51805 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PLXNA3P51805 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PLXNA3P51805 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PLXNA3P51805 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PLXNA3P51805 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PLXNA3P51805 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PLXNA3P51805 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PLXNA3P51805 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLXNA3P51805 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PLXNA3P51805 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PLXNA3P51805 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLXNA3P51805 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PLXNA3P51805 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PLXNA3P51805 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNA3P51805 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNA3P51805 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PLXNA3P51805 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PLXNA3P51805 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PLXNA3P51805 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PLXNA3P51805 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PLXNA3P51805 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PLXNA3P51805 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PLXNA3P51805 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PLXNA3P51805 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PLXNA3P51805 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PLXNA3P51805 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PLXNA3P51805 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PLXNA3P51805 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PLXNA3P51805 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PLXNA3P51805 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PLXNA3P51805 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLXNA3P51805 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLXNA3P51805 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLXNA3P51805 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PLXNA3P51805 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PLXNA3P51805 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PLXNA3P51805 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PLXNA3P51805 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PLXNA3P51805 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLXNA3P51805 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLXNA3P51805 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PLXNA3P51805 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PLXNA3P51805 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PLXNA3P51805 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PLXNA3P51805 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PLXNA3P51805 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms