Protein–RNA interactions for Protein: P49703

ARL4D, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4DP49703 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARL4DP49703 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARL4DP49703 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARL4DP49703 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARL4DP49703 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARL4DP49703 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARL4DP49703 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ARL4DP49703 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARL4DP49703 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARL4DP49703 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARL4DP49703 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARL4DP49703 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARL4DP49703 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARL4DP49703 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARL4DP49703 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARL4DP49703 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARL4DP49703 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARL4DP49703 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARL4DP49703 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARL4DP49703 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARL4DP49703 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARL4DP49703 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARL4DP49703 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARL4DP49703 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARL4DP49703 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARL4DP49703 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARL4DP49703 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARL4DP49703 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARL4DP49703 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARL4DP49703 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARL4DP49703 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARL4DP49703 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARL4DP49703 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARL4DP49703 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARL4DP49703 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARL4DP49703 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARL4DP49703 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARL4DP49703 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARL4DP49703 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARL4DP49703 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ARL4DP49703 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARL4DP49703 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARL4DP49703 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARL4DP49703 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARL4DP49703 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARL4DP49703 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARL4DP49703 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARL4DP49703 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARL4DP49703 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARL4DP49703 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARL4DP49703 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARL4DP49703 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARL4DP49703 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARL4DP49703 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARL4DP49703 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARL4DP49703 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARL4DP49703 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARL4DP49703 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL4DP49703 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARL4DP49703 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL4DP49703 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARL4DP49703 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARL4DP49703 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARL4DP49703 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL4DP49703 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL4DP49703 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL4DP49703 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL4DP49703 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARL4DP49703 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL4DP49703 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL4DP49703 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL4DP49703 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARL4DP49703 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL4DP49703 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL4DP49703 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARL4DP49703 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARL4DP49703 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL4DP49703 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL4DP49703 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARL4DP49703 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARL4DP49703 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL4DP49703 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL4DP49703 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARL4DP49703 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARL4DP49703 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARL4DP49703 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARL4DP49703 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARL4DP49703 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms