Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGEA1P43355 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAGEA1P43355 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAGEA1P43355 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAGEA1P43355 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAGEA1P43355 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
MAGEA1P43355 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAGEA1P43355 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAGEA1P43355 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAGEA1P43355 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAGEA1P43355 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAGEA1P43355 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAGEA1P43355 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MAGEA1P43355 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MAGEA1P43355 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAGEA1P43355 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAGEA1P43355 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAGEA1P43355 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAGEA1P43355 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAGEA1P43355 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MAGEA1P43355 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAGEA1P43355 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAGEA1P43355 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAGEA1P43355 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MAGEA1P43355 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAGEA1P43355 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAGEA1P43355 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAGEA1P43355 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAGEA1P43355 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAGEA1P43355 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAGEA1P43355 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MAGEA1P43355 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MAGEA1P43355 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MAGEA1P43355 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MAGEA1P43355 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MAGEA1P43355 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAGEA1P43355 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAGEA1P43355 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAGEA1P43355 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAGEA1P43355 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAGEA1P43355 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAGEA1P43355 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAGEA1P43355 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAGEA1P43355 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MAGEA1P43355 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAGEA1P43355 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MAGEA1P43355 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAGEA1P43355 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MAGEA1P43355 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MAGEA1P43355 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MAGEA1P43355 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MAGEA1P43355 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MAGEA1P43355 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MAGEA1P43355 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAGEA1P43355 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAGEA1P43355 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAGEA1P43355 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAGEA1P43355 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MAGEA1P43355 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MAGEA1P43355 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MAGEA1P43355 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MAGEA1P43355 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MAGEA1P43355 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MAGEA1P43355 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MAGEA1P43355 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MAGEA1P43355 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MAGEA1P43355 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MAGEA1P43355 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MAGEA1P43355 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MAGEA1P43355 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MAGEA1P43355 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MAGEA1P43355 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MAGEA1P43355 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MAGEA1P43355 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAGEA1P43355 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MAGEA1P43355 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MAGEA1P43355 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MAGEA1P43355 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MAGEA1P43355 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MAGEA1P43355 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MAGEA1P43355 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MAGEA1P43355 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAGEA1P43355 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAGEA1P43355 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
MAGEA1P43355 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MAGEA1P43355 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MAGEA1P43355 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MAGEA1P43355 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MAGEA1P43355 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MAGEA1P43355 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MAGEA1P43355 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MAGEA1P43355 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MAGEA1P43355 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAGEA1P43355 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms