Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KRT2P35908 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
KRT2P35908 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
KRT2P35908 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KRT2P35908 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KRT2P35908 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KRT2P35908 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KRT2P35908 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KRT2P35908 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KRT2P35908 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KRT2P35908 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KRT2P35908 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KRT2P35908 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KRT2P35908 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KRT2P35908 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KRT2P35908 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KRT2P35908 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KRT2P35908 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KRT2P35908 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KRT2P35908 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KRT2P35908 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KRT2P35908 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KRT2P35908 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KRT2P35908 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KRT2P35908 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KRT2P35908 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KRT2P35908 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KRT2P35908 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KRT2P35908 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KRT2P35908 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KRT2P35908 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT2P35908 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT2P35908 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT2P35908 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KRT2P35908 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KRT2P35908 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT2P35908 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KRT2P35908 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT2P35908 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT2P35908 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT2P35908 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KRT2P35908 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT2P35908 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT2P35908 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT2P35908 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT2P35908 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KRT2P35908 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KRT2P35908 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KRT2P35908 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KRT2P35908 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT2P35908 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT2P35908 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT2P35908 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT2P35908 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT2P35908 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KRT2P35908 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KRT2P35908 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KRT2P35908 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KRT2P35908 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KRT2P35908 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KRT2P35908 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KRT2P35908 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KRT2P35908 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KRT2P35908 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KRT2P35908 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KRT2P35908 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KRT2P35908 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT2P35908 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT2P35908 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT2P35908 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT2P35908 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT2P35908 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT2P35908 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KRT2P35908 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT2P35908 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KRT2P35908 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
KRT2P35908 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KRT2P35908 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT2P35908 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT2P35908 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT2P35908 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT2P35908 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT2P35908 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT2P35908 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KRT2P35908 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KRT2P35908 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT2P35908 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT2P35908 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
KRT2P35908 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KRT2P35908 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT2P35908 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KRT2P35908 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KRT2P35908 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT2P35908 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT2P35908 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT2P35908 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT2P35908 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT2P35908 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT2P35908 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT2P35908 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms