Protein–RNA interactions for Protein: P35579

MYH9, Myosin-9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH9P35579 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MYH9P35579 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYH9P35579 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MYH9P35579 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MYH9P35579 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MYH9P35579 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
MYH9P35579 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYH9P35579 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MYH9P35579 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MYH9P35579 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MYH9P35579 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MYH9P35579 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYH9P35579 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYH9P35579 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYH9P35579 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MYH9P35579 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MYH9P35579 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MYH9P35579 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MYH9P35579 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MYH9P35579 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MYH9P35579 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MYH9P35579 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MYH9P35579 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MYH9P35579 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MYH9P35579 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYH9P35579 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MYH9P35579 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MYH9P35579 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MYH9P35579 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH9P35579 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH9P35579 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MYH9P35579 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH9P35579 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYH9P35579 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYH9P35579 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYH9P35579 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MYH9P35579 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MYH9P35579 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MYH9P35579 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
MYH9P35579 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH9P35579 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH9P35579 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYH9P35579 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYH9P35579 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYH9P35579 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYH9P35579 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
MYH9P35579 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH9P35579 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH9P35579 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYH9P35579 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MYH9P35579 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH9P35579 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MYH9P35579 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH9P35579 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH9P35579 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MYH9P35579 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MYH9P35579 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH9P35579 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MYH9P35579 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MYH9P35579 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYH9P35579 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYH9P35579 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH9P35579 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MYH9P35579 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MYH9P35579 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH9P35579 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH9P35579 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MYH9P35579 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MYH9P35579 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MYH9P35579 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MYH9P35579 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MYH9P35579 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MYH9P35579 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MYH9P35579 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MYH9P35579 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MYH9P35579 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MYH9P35579 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MYH9P35579 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MYH9P35579 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MYH9P35579 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MYH9P35579 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MYH9P35579 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MYH9P35579 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MYH9P35579 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MYH9P35579 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MYH9P35579 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MYH9P35579 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MYH9P35579 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MYH9P35579 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MYH9P35579 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MYH9P35579 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MYH9P35579 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MYH9P35579 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MYH9P35579 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MYH9P35579 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MYH9P35579 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MYH9P35579 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MYH9P35579 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MYH9P35579 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MYH9P35579 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms