Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SDC2P34741 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDC2P34741 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDC2P34741 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDC2P34741 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SDC2P34741 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDC2P34741 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDC2P34741 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SDC2P34741 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDC2P34741 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SDC2P34741 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDC2P34741 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDC2P34741 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDC2P34741 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDC2P34741 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDC2P34741 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDC2P34741 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDC2P34741 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDC2P34741 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDC2P34741 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDC2P34741 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDC2P34741 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDC2P34741 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDC2P34741 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDC2P34741 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDC2P34741 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDC2P34741 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDC2P34741 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDC2P34741 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDC2P34741 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDC2P34741 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDC2P34741 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDC2P34741 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDC2P34741 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDC2P34741 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDC2P34741 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDC2P34741 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDC2P34741 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDC2P34741 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDC2P34741 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDC2P34741 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDC2P34741 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDC2P34741 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDC2P34741 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDC2P34741 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDC2P34741 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDC2P34741 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDC2P34741 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDC2P34741 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDC2P34741 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDC2P34741 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDC2P34741 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDC2P34741 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDC2P34741 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDC2P34741 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SDC2P34741 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDC2P34741 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDC2P34741 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDC2P34741 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDC2P34741 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDC2P34741 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDC2P34741 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDC2P34741 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDC2P34741 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDC2P34741 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDC2P34741 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDC2P34741 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDC2P34741 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDC2P34741 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDC2P34741 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDC2P34741 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDC2P34741 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDC2P34741 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDC2P34741 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDC2P34741 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDC2P34741 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDC2P34741 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDC2P34741 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDC2P34741 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDC2P34741 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDC2P34741 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDC2P34741 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDC2P34741 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDC2P34741 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDC2P34741 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDC2P34741 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDC2P34741 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDC2P34741 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDC2P34741 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDC2P34741 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDC2P34741 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDC2P34741 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDC2P34741 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDC2P34741 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDC2P34741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDC2P34741 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDC2P34741 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC2P34741 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDC2P34741 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDC2P34741 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms