Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCND2P30279 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCND2P30279 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCND2P30279 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCND2P30279 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCND2P30279 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCND2P30279 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CCND2P30279 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCND2P30279 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCND2P30279 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCND2P30279 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCND2P30279 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCND2P30279 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCND2P30279 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCND2P30279 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCND2P30279 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCND2P30279 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCND2P30279 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCND2P30279 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCND2P30279 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCND2P30279 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCND2P30279 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCND2P30279 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCND2P30279 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCND2P30279 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCND2P30279 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCND2P30279 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCND2P30279 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCND2P30279 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCND2P30279 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCND2P30279 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCND2P30279 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCND2P30279 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCND2P30279 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCND2P30279 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCND2P30279 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCND2P30279 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCND2P30279 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCND2P30279 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCND2P30279 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCND2P30279 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCND2P30279 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCND2P30279 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCND2P30279 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCND2P30279 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCND2P30279 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CCND2P30279 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCND2P30279 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCND2P30279 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCND2P30279 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCND2P30279 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCND2P30279 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCND2P30279 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCND2P30279 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCND2P30279 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCND2P30279 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCND2P30279 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCND2P30279 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCND2P30279 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCND2P30279 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCND2P30279 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCND2P30279 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCND2P30279 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCND2P30279 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
CCND2P30279 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCND2P30279 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCND2P30279 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCND2P30279 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCND2P30279 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCND2P30279 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCND2P30279 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCND2P30279 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCND2P30279 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCND2P30279 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCND2P30279 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCND2P30279 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCND2P30279 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCND2P30279 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCND2P30279 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCND2P30279 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCND2P30279 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCND2P30279 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCND2P30279 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCND2P30279 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCND2P30279 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCND2P30279 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCND2P30279 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCND2P30279 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCND2P30279 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCND2P30279 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCND2P30279 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCND2P30279 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCND2P30279 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCND2P30279 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCND2P30279 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCND2P30279 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCND2P30279 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCND2P30279 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCND2P30279 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCND2P30279 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms