Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
IVDP26440 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IVDP26440 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IVDP26440 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
IVDP26440 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IVDP26440 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.82■■■■□ 3
IVDP26440 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IVDP26440 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IVDP26440 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IVDP26440 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IVDP26440 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IVDP26440 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IVDP26440 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
IVDP26440 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IVDP26440 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IVDP26440 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IVDP26440 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IVDP26440 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IVDP26440 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IVDP26440 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IVDP26440 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IVDP26440 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IVDP26440 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IVDP26440 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IVDP26440 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IVDP26440 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
IVDP26440 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IVDP26440 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
IVDP26440 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
IVDP26440 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IVDP26440 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
IVDP26440 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IVDP26440 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
IVDP26440 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IVDP26440 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IVDP26440 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
IVDP26440 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IVDP26440 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IVDP26440 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IVDP26440 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IVDP26440 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IVDP26440 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IVDP26440 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IVDP26440 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IVDP26440 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IVDP26440 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IVDP26440 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IVDP26440 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IVDP26440 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IVDP26440 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IVDP26440 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IVDP26440 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IVDP26440 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IVDP26440 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IVDP26440 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IVDP26440 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IVDP26440 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IVDP26440 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IVDP26440 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IVDP26440 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IVDP26440 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IVDP26440 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IVDP26440 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IVDP26440 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
IVDP26440 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IVDP26440 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IVDP26440 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IVDP26440 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IVDP26440 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IVDP26440 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IVDP26440 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IVDP26440 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IVDP26440 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IVDP26440 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IVDP26440 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IVDP26440 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IVDP26440 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IVDP26440 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IVDP26440 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IVDP26440 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IVDP26440 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IVDP26440 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IVDP26440 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IVDP26440 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IVDP26440 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IVDP26440 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IVDP26440 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IVDP26440 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IVDP26440 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IVDP26440 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IVDP26440 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IVDP26440 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IVDP26440 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IVDP26440 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IVDP26440 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IVDP26440 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IVDP26440 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IVDP26440 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IVDP26440 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IVDP26440 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms