Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLRA1P23415 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLRA1P23415 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GLRA1P23415 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GLRA1P23415 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLRA1P23415 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLRA1P23415 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLRA1P23415 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLRA1P23415 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLRA1P23415 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GLRA1P23415 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLRA1P23415 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLRA1P23415 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLRA1P23415 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLRA1P23415 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLRA1P23415 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLRA1P23415 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLRA1P23415 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLRA1P23415 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLRA1P23415 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLRA1P23415 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLRA1P23415 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLRA1P23415 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLRA1P23415 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLRA1P23415 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLRA1P23415 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLRA1P23415 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLRA1P23415 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLRA1P23415 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLRA1P23415 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLRA1P23415 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLRA1P23415 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLRA1P23415 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLRA1P23415 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLRA1P23415 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLRA1P23415 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLRA1P23415 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLRA1P23415 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLRA1P23415 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLRA1P23415 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLRA1P23415 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLRA1P23415 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLRA1P23415 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLRA1P23415 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLRA1P23415 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLRA1P23415 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLRA1P23415 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLRA1P23415 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLRA1P23415 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLRA1P23415 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLRA1P23415 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLRA1P23415 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLRA1P23415 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLRA1P23415 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLRA1P23415 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLRA1P23415 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLRA1P23415 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLRA1P23415 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLRA1P23415 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLRA1P23415 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLRA1P23415 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLRA1P23415 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLRA1P23415 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLRA1P23415 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLRA1P23415 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLRA1P23415 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLRA1P23415 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLRA1P23415 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLRA1P23415 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLRA1P23415 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLRA1P23415 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLRA1P23415 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLRA1P23415 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLRA1P23415 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GLRA1P23415 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GLRA1P23415 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLRA1P23415 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLRA1P23415 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLRA1P23415 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLRA1P23415 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLRA1P23415 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLRA1P23415 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLRA1P23415 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLRA1P23415 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLRA1P23415 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLRA1P23415 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLRA1P23415 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLRA1P23415 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLRA1P23415 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLRA1P23415 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLRA1P23415 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLRA1P23415 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLRA1P23415 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLRA1P23415 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms