Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGHV1-2P23083 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHV1-2P23083 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGHV1-2P23083 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHV1-2P23083 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IGHV1-2P23083 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGHV1-2P23083 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGHV1-2P23083 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGHV1-2P23083 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGHV1-2P23083 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHV1-2P23083 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHV1-2P23083 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHV1-2P23083 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHV1-2P23083 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHV1-2P23083 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHV1-2P23083 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHV1-2P23083 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHV1-2P23083 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHV1-2P23083 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGHV1-2P23083 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHV1-2P23083 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHV1-2P23083 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGHV1-2P23083 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGHV1-2P23083 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGHV1-2P23083 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHV1-2P23083 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHV1-2P23083 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHV1-2P23083 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHV1-2P23083 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHV1-2P23083 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHV1-2P23083 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHV1-2P23083 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHV1-2P23083 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGHV1-2P23083 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGHV1-2P23083 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGHV1-2P23083 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGHV1-2P23083 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHV1-2P23083 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHV1-2P23083 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHV1-2P23083 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHV1-2P23083 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHV1-2P23083 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHV1-2P23083 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGHV1-2P23083 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGHV1-2P23083 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGHV1-2P23083 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IGHV1-2P23083 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGHV1-2P23083 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGHV1-2P23083 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHV1-2P23083 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHV1-2P23083 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHV1-2P23083 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHV1-2P23083 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHV1-2P23083 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IGHV1-2P23083 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGHV1-2P23083 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGHV1-2P23083 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGHV1-2P23083 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGHV1-2P23083 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IGHV1-2P23083 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGHV1-2P23083 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGHV1-2P23083 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGHV1-2P23083 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGHV1-2P23083 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGHV1-2P23083 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGHV1-2P23083 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGHV1-2P23083 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHV1-2P23083 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHV1-2P23083 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGHV1-2P23083 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGHV1-2P23083 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGHV1-2P23083 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGHV1-2P23083 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGHV1-2P23083 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHV1-2P23083 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHV1-2P23083 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHV1-2P23083 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHV1-2P23083 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHV1-2P23083 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHV1-2P23083 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHV1-2P23083 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHV1-2P23083 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHV1-2P23083 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV1-2P23083 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHV1-2P23083 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHV1-2P23083 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHV1-2P23083 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV1-2P23083 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHV1-2P23083 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV1-2P23083 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV1-2P23083 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV1-2P23083 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV1-2P23083 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms