Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NAGAP17050 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NAGAP17050 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NAGAP17050 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NAGAP17050 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NAGAP17050 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NAGAP17050 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NAGAP17050 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NAGAP17050 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NAGAP17050 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NAGAP17050 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NAGAP17050 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NAGAP17050 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NAGAP17050 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NAGAP17050 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NAGAP17050 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NAGAP17050 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NAGAP17050 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NAGAP17050 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NAGAP17050 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NAGAP17050 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NAGAP17050 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NAGAP17050 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAGAP17050 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAGAP17050 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAGAP17050 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NAGAP17050 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAGAP17050 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAGAP17050 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAGAP17050 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAGAP17050 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAGAP17050 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAGAP17050 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAGAP17050 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAGAP17050 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAGAP17050 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGAP17050 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGAP17050 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAGAP17050 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAGAP17050 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAGAP17050 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAGAP17050 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAGAP17050 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAGAP17050 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAGAP17050 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAGAP17050 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAGAP17050 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAGAP17050 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NAGAP17050 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NAGAP17050 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NAGAP17050 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NAGAP17050 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAGAP17050 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NAGAP17050 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NAGAP17050 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NAGAP17050 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NAGAP17050 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NAGAP17050 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NAGAP17050 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NAGAP17050 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NAGAP17050 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NAGAP17050 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NAGAP17050 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NAGAP17050 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAGAP17050 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NAGAP17050 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAGAP17050 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAGAP17050 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NAGAP17050 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NAGAP17050 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAGAP17050 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAGAP17050 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAGAP17050 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NAGAP17050 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAGAP17050 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAGAP17050 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAGAP17050 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAGAP17050 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAGAP17050 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NAGAP17050 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAGAP17050 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAGAP17050 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAGAP17050 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAGAP17050 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAGAP17050 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAGAP17050 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAGAP17050 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAGAP17050 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAGAP17050 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAGAP17050 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAGAP17050 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAGAP17050 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAGAP17050 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAGAP17050 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAGAP17050 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAGAP17050 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAGAP17050 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAGAP17050 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NAGAP17050 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAGAP17050 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms