Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAX1P15863 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PAX1P15863 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAX1P15863 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAX1P15863 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAX1P15863 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAX1P15863 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAX1P15863 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX1P15863 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAX1P15863 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX1P15863 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PAX1P15863 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAX1P15863 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX1P15863 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX1P15863 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAX1P15863 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAX1P15863 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX1P15863 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX1P15863 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAX1P15863 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAX1P15863 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX1P15863 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX1P15863 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAX1P15863 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAX1P15863 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAX1P15863 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAX1P15863 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAX1P15863 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAX1P15863 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAX1P15863 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAX1P15863 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX1P15863 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX1P15863 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX1P15863 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAX1P15863 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX1P15863 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX1P15863 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PAX1P15863 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX1P15863 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX1P15863 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAX1P15863 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX1P15863 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX1P15863 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX1P15863 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX1P15863 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX1P15863 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX1P15863 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX1P15863 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX1P15863 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX1P15863 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX1P15863 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX1P15863 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX1P15863 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX1P15863 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX1P15863 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX1P15863 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX1P15863 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX1P15863 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX1P15863 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAX1P15863 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX1P15863 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX1P15863 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX1P15863 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX1P15863 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX1P15863 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX1P15863 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX1P15863 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX1P15863 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX1P15863 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX1P15863 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX1P15863 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX1P15863 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX1P15863 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX1P15863 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX1P15863 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX1P15863 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAX1P15863 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX1P15863 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX1P15863 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX1P15863 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX1P15863 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX1P15863 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX1P15863 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX1P15863 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX1P15863 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX1P15863 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX1P15863 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX1P15863 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX1P15863 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX1P15863 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX1P15863 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX1P15863 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX1P15863 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX1P15863 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX1P15863 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAX1P15863 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX1P15863 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX1P15863 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX1P15863 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAX1P15863 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms