Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.21■■■■■ 5.47
LAMC1P11047 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
LAMC1P11047 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
LAMC1P11047 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
LAMC1P11047 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
LAMC1P11047 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.21
LAMC1P11047 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
LAMC1P11047 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
LAMC1P11047 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
LAMC1P11047 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
LAMC1P11047 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
LAMC1P11047 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
LAMC1P11047 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
LAMC1P11047 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
LAMC1P11047 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
LAMC1P11047 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC1P11047 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.93
LAMC1P11047 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
LAMC1P11047 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
LAMC1P11047 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
LAMC1P11047 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
LAMC1P11047 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
LAMC1P11047 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
LAMC1P11047 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
LAMC1P11047 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
LAMC1P11047 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
LAMC1P11047 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
LAMC1P11047 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
LAMC1P11047 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
LAMC1P11047 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC1P11047 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
LAMC1P11047 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
LAMC1P11047 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
LAMC1P11047 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
LAMC1P11047 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
LAMC1P11047 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
LAMC1P11047 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
LAMC1P11047 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
LAMC1P11047 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
LAMC1P11047 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
LAMC1P11047 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
LAMC1P11047 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
LAMC1P11047 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
LAMC1P11047 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
LAMC1P11047 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
LAMC1P11047 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
LAMC1P11047 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC1P11047 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC1P11047 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
LAMC1P11047 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
LAMC1P11047 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
LAMC1P11047 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
LAMC1P11047 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
LAMC1P11047 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
LAMC1P11047 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
LAMC1P11047 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
LAMC1P11047 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
LAMC1P11047 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
LAMC1P11047 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
LAMC1P11047 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
LAMC1P11047 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
LAMC1P11047 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
LAMC1P11047 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
LAMC1P11047 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
LAMC1P11047 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
LAMC1P11047 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
LAMC1P11047 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
LAMC1P11047 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
LAMC1P11047 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
LAMC1P11047 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
LAMC1P11047 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
LAMC1P11047 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC1P11047 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
LAMC1P11047 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC1P11047 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC1P11047 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LAMC1P11047 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
LAMC1P11047 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
LAMC1P11047 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
LAMC1P11047 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
LAMC1P11047 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
LAMC1P11047 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
LAMC1P11047 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC1P11047 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
LAMC1P11047 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
LAMC1P11047 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
LAMC1P11047 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC1P11047 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC1P11047 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC1P11047 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms