Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CALM1P0DP23 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CALM1P0DP23 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CALM1P0DP23 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CALM1P0DP23 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CALM1P0DP23 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CALM1P0DP23 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CALM1P0DP23 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CALM1P0DP23 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CALM1P0DP23 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CALM1P0DP23 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CALM1P0DP23 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CALM1P0DP23 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CALM1P0DP23 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CALM1P0DP23 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CALM1P0DP23 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CALM1P0DP23 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CALM1P0DP23 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CALM1P0DP23 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CALM1P0DP23 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CALM1P0DP23 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CALM1P0DP23 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CALM1P0DP23 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CALM1P0DP23 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CALM1P0DP23 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CALM1P0DP23 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CALM1P0DP23 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CALM1P0DP23 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CALM1P0DP23 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CALM1P0DP23 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CALM1P0DP23 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CALM1P0DP23 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CALM1P0DP23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CALM1P0DP23 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CALM1P0DP23 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CALM1P0DP23 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CALM1P0DP23 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CALM1P0DP23 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CALM1P0DP23 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CALM1P0DP23 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CALM1P0DP23 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CALM1P0DP23 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CALM1P0DP23 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CALM1P0DP23 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CALM1P0DP23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CALM1P0DP23 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CALM1P0DP23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CALM1P0DP23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CALM1P0DP23 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CALM1P0DP23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CALM1P0DP23 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CALM1P0DP23 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CALM1P0DP23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CALM1P0DP23 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CALM1P0DP23 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CALM1P0DP23 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CALM1P0DP23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CALM1P0DP23 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CALM1P0DP23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CALM1P0DP23 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CALM1P0DP23 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CALM1P0DP23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CALM1P0DP23 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CALM1P0DP23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CALM1P0DP23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CALM1P0DP23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CALM1P0DP23 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CALM1P0DP23 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CALM1P0DP23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CALM1P0DP23 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CALM1P0DP23 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CALM1P0DP23 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CALM1P0DP23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CALM1P0DP23 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CALM1P0DP23 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CALM1P0DP23 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CALM1P0DP23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CALM1P0DP23 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CALM1P0DP23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CALM1P0DP23 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CALM1P0DP23 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CALM1P0DP23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CALM1P0DP23 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CALM1P0DP23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CALM1P0DP23 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CALM1P0DP23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CALM1P0DP23 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CALM1P0DP23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CALM1P0DP23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CALM1P0DP23 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CALM1P0DP23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CALM1P0DP23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CALM1P0DP23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CALM1P0DP23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CALM1P0DP23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CALM1P0DP23 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALM1P0DP23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CALM1P0DP23 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALM1P0DP23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CALM1P0DP23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms