Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
HSP90AB1P08238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
HSP90AB1P08238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
HSP90AB1P08238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
HSP90AB1P08238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
HSP90AB1P08238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HSP90AB1P08238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
HSP90AB1P08238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
HSP90AB1P08238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HSP90AB1P08238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HSP90AB1P08238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
HSP90AB1P08238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
HSP90AB1P08238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
HSP90AB1P08238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HSP90AB1P08238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HSP90AB1P08238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
HSP90AB1P08238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
HSP90AB1P08238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HSP90AB1P08238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
HSP90AB1P08238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HSP90AB1P08238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HSP90AB1P08238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
HSP90AB1P08238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HSP90AB1P08238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
HSP90AB1P08238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HSP90AB1P08238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HSP90AB1P08238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HSP90AB1P08238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
HSP90AB1P08238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HSP90AB1P08238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
HSP90AB1P08238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
HSP90AB1P08238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HSP90AB1P08238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
HSP90AB1P08238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HSP90AB1P08238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
HSP90AB1P08238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HSP90AB1P08238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HSP90AB1P08238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
HSP90AB1P08238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HSP90AB1P08238 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HSP90AB1P08238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HSP90AB1P08238 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HSP90AB1P08238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HSP90AB1P08238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
HSP90AB1P08238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
HSP90AB1P08238 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
HSP90AB1P08238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
HSP90AB1P08238 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HSP90AB1P08238 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HSP90AB1P08238 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
HSP90AB1P08238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HSP90AB1P08238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HSP90AB1P08238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms