Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSMBP08118 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSMBP08118 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSMBP08118 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSMBP08118 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSMBP08118 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MSMBP08118 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSMBP08118 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MSMBP08118 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSMBP08118 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSMBP08118 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSMBP08118 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSMBP08118 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSMBP08118 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSMBP08118 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSMBP08118 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSMBP08118 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSMBP08118 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSMBP08118 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSMBP08118 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSMBP08118 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSMBP08118 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSMBP08118 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSMBP08118 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSMBP08118 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSMBP08118 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSMBP08118 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSMBP08118 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSMBP08118 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSMBP08118 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSMBP08118 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSMBP08118 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSMBP08118 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSMBP08118 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSMBP08118 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSMBP08118 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSMBP08118 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSMBP08118 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSMBP08118 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSMBP08118 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSMBP08118 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSMBP08118 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSMBP08118 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSMBP08118 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSMBP08118 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSMBP08118 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSMBP08118 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSMBP08118 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSMBP08118 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSMBP08118 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSMBP08118 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSMBP08118 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSMBP08118 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSMBP08118 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSMBP08118 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSMBP08118 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSMBP08118 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSMBP08118 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSMBP08118 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSMBP08118 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSMBP08118 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSMBP08118 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSMBP08118 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSMBP08118 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSMBP08118 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSMBP08118 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSMBP08118 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSMBP08118 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSMBP08118 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSMBP08118 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSMBP08118 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSMBP08118 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSMBP08118 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSMBP08118 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSMBP08118 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSMBP08118 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSMBP08118 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSMBP08118 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSMBP08118 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSMBP08118 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSMBP08118 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSMBP08118 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSMBP08118 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSMBP08118 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSMBP08118 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSMBP08118 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSMBP08118 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSMBP08118 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSMBP08118 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSMBP08118 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSMBP08118 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSMBP08118 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSMBP08118 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSMBP08118 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSMBP08118 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSMBP08118 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSMBP08118 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSMBP08118 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSMBP08118 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSMBP08118 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms