Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KLHL2O95198 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KLHL2O95198 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KLHL2O95198 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
KLHL2O95198 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
KLHL2O95198 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KLHL2O95198 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KLHL2O95198 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KLHL2O95198 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KLHL2O95198 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KLHL2O95198 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KLHL2O95198 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KLHL2O95198 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KLHL2O95198 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KLHL2O95198 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHL2O95198 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHL2O95198 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KLHL2O95198 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KLHL2O95198 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KLHL2O95198 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KLHL2O95198 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KLHL2O95198 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL2O95198 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KLHL2O95198 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KLHL2O95198 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KLHL2O95198 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL2O95198 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHL2O95198 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL2O95198 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHL2O95198 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL2O95198 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KLHL2O95198 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLHL2O95198 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KLHL2O95198 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KLHL2O95198 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL2O95198 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL2O95198 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL2O95198 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHL2O95198 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHL2O95198 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHL2O95198 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KLHL2O95198 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHL2O95198 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHL2O95198 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KLHL2O95198 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHL2O95198 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHL2O95198 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHL2O95198 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHL2O95198 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHL2O95198 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL2O95198 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL2O95198 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL2O95198 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL2O95198 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL2O95198 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL2O95198 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL2O95198 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL2O95198 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL2O95198 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL2O95198 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHL2O95198 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL2O95198 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KLHL2O95198 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL2O95198 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL2O95198 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL2O95198 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KLHL2O95198 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL2O95198 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL2O95198 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL2O95198 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL2O95198 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KLHL2O95198 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL2O95198 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL2O95198 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHL2O95198 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHL2O95198 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL2O95198 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL2O95198 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL2O95198 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL2O95198 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHL2O95198 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL2O95198 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms