Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CNTN5O94779 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CNTN5O94779 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CNTN5O94779 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CNTN5O94779 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTN5O94779 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTN5O94779 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNTN5O94779 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTN5O94779 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNTN5O94779 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTN5O94779 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNTN5O94779 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNTN5O94779 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNTN5O94779 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNTN5O94779 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNTN5O94779 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNTN5O94779 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNTN5O94779 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNTN5O94779 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTN5O94779 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNTN5O94779 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTN5O94779 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTN5O94779 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTN5O94779 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNTN5O94779 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNTN5O94779 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNTN5O94779 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNTN5O94779 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTN5O94779 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNTN5O94779 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNTN5O94779 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNTN5O94779 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNTN5O94779 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNTN5O94779 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNTN5O94779 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNTN5O94779 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTN5O94779 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTN5O94779 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTN5O94779 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNTN5O94779 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTN5O94779 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNTN5O94779 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNTN5O94779 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNTN5O94779 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNTN5O94779 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNTN5O94779 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNTN5O94779 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNTN5O94779 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNTN5O94779 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CNTN5O94779 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNTN5O94779 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNTN5O94779 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNTN5O94779 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNTN5O94779 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNTN5O94779 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTN5O94779 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTN5O94779 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNTN5O94779 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNTN5O94779 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNTN5O94779 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNTN5O94779 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CNTN5O94779 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNTN5O94779 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNTN5O94779 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTN5O94779 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTN5O94779 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTN5O94779 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTN5O94779 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTN5O94779 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTN5O94779 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNTN5O94779 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNTN5O94779 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTN5O94779 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTN5O94779 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNTN5O94779 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTN5O94779 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTN5O94779 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNTN5O94779 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTN5O94779 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTN5O94779 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTN5O94779 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNTN5O94779 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNTN5O94779 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNTN5O94779 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTN5O94779 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTN5O94779 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTN5O94779 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNTN5O94779 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms