Protein–RNA interactions for Protein: O75900

MMP23A, Matrix metalloproteinase-23, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23AO75900 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP23AO75900 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP23AO75900 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP23AO75900 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP23AO75900 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP23AO75900 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP23AO75900 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP23AO75900 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP23AO75900 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP23AO75900 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP23AO75900 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP23AO75900 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP23AO75900 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP23AO75900 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP23AO75900 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP23AO75900 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP23AO75900 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP23AO75900 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP23AO75900 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP23AO75900 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP23AO75900 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP23AO75900 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP23AO75900 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP23AO75900 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP23AO75900 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP23AO75900 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP23AO75900 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP23AO75900 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP23AO75900 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP23AO75900 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP23AO75900 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP23AO75900 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP23AO75900 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP23AO75900 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP23AO75900 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP23AO75900 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP23AO75900 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP23AO75900 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP23AO75900 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP23AO75900 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP23AO75900 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP23AO75900 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP23AO75900 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP23AO75900 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP23AO75900 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP23AO75900 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP23AO75900 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP23AO75900 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP23AO75900 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP23AO75900 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP23AO75900 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP23AO75900 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP23AO75900 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP23AO75900 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP23AO75900 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP23AO75900 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP23AO75900 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP23AO75900 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP23AO75900 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP23AO75900 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP23AO75900 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP23AO75900 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP23AO75900 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP23AO75900 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP23AO75900 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP23AO75900 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP23AO75900 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP23AO75900 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP23AO75900 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP23AO75900 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP23AO75900 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP23AO75900 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP23AO75900 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP23AO75900 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP23AO75900 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP23AO75900 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP23AO75900 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP23AO75900 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP23AO75900 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP23AO75900 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP23AO75900 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP23AO75900 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP23AO75900 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP23AO75900 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP23AO75900 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP23AO75900 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP23AO75900 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP23AO75900 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP23AO75900 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP23AO75900 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP23AO75900 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP23AO75900 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP23AO75900 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP23AO75900 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP23AO75900 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP23AO75900 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP23AO75900 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP23AO75900 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP23AO75900 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP23AO75900 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms