Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLEC3AO75596 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLEC3AO75596 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CLEC3AO75596 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLEC3AO75596 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLEC3AO75596 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLEC3AO75596 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CLEC3AO75596 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLEC3AO75596 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLEC3AO75596 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLEC3AO75596 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLEC3AO75596 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLEC3AO75596 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLEC3AO75596 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLEC3AO75596 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLEC3AO75596 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLEC3AO75596 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLEC3AO75596 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLEC3AO75596 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLEC3AO75596 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLEC3AO75596 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLEC3AO75596 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLEC3AO75596 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLEC3AO75596 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLEC3AO75596 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLEC3AO75596 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLEC3AO75596 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLEC3AO75596 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLEC3AO75596 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLEC3AO75596 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLEC3AO75596 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLEC3AO75596 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC3AO75596 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC3AO75596 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLEC3AO75596 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLEC3AO75596 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLEC3AO75596 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC3AO75596 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC3AO75596 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLEC3AO75596 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLEC3AO75596 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLEC3AO75596 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLEC3AO75596 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLEC3AO75596 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLEC3AO75596 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLEC3AO75596 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLEC3AO75596 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLEC3AO75596 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLEC3AO75596 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLEC3AO75596 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLEC3AO75596 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLEC3AO75596 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLEC3AO75596 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLEC3AO75596 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLEC3AO75596 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLEC3AO75596 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLEC3AO75596 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLEC3AO75596 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC3AO75596 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLEC3AO75596 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC3AO75596 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC3AO75596 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLEC3AO75596 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLEC3AO75596 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLEC3AO75596 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLEC3AO75596 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLEC3AO75596 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC3AO75596 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC3AO75596 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC3AO75596 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC3AO75596 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC3AO75596 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC3AO75596 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLEC3AO75596 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC3AO75596 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLEC3AO75596 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC3AO75596 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLEC3AO75596 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLEC3AO75596 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLEC3AO75596 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLEC3AO75596 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC3AO75596 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC3AO75596 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC3AO75596 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms