Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CYTH3O43739 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CYTH3O43739 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CYTH3O43739 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CYTH3O43739 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CYTH3O43739 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CYTH3O43739 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CYTH3O43739 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CYTH3O43739 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CYTH3O43739 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CYTH3O43739 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CYTH3O43739 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CYTH3O43739 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CYTH3O43739 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CYTH3O43739 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CYTH3O43739 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CYTH3O43739 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CYTH3O43739 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CYTH3O43739 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CYTH3O43739 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CYTH3O43739 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CYTH3O43739 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CYTH3O43739 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CYTH3O43739 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CYTH3O43739 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CYTH3O43739 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CYTH3O43739 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CYTH3O43739 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CYTH3O43739 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CYTH3O43739 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CYTH3O43739 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CYTH3O43739 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CYTH3O43739 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CYTH3O43739 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CYTH3O43739 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CYTH3O43739 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CYTH3O43739 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CYTH3O43739 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CYTH3O43739 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CYTH3O43739 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CYTH3O43739 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CYTH3O43739 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CYTH3O43739 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CYTH3O43739 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CYTH3O43739 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CYTH3O43739 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CYTH3O43739 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CYTH3O43739 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CYTH3O43739 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CYTH3O43739 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CYTH3O43739 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CYTH3O43739 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CYTH3O43739 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CYTH3O43739 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CYTH3O43739 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CYTH3O43739 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CYTH3O43739 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CYTH3O43739 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CYTH3O43739 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CYTH3O43739 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CYTH3O43739 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CYTH3O43739 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CYTH3O43739 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CYTH3O43739 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CYTH3O43739 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CYTH3O43739 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CYTH3O43739 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CYTH3O43739 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CYTH3O43739 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CYTH3O43739 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CYTH3O43739 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CYTH3O43739 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CYTH3O43739 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CYTH3O43739 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CYTH3O43739 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CYTH3O43739 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CYTH3O43739 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYTH3O43739 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CYTH3O43739 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CYTH3O43739 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CYTH3O43739 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CYTH3O43739 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CYTH3O43739 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CYTH3O43739 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CYTH3O43739 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CYTH3O43739 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CYTH3O43739 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CYTH3O43739 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CYTH3O43739 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CYTH3O43739 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CYTH3O43739 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CYTH3O43739 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CYTH3O43739 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CYTH3O43739 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CYTH3O43739 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYTH3O43739 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CYTH3O43739 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CYTH3O43739 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYTH3O43739 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYTH3O43739 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms